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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002208`

染色体: Chr03 坐标: 34776289-34778102 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002208`
名称	SmilChr03G002208
描述	CASP-like protein 4B1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	34776289 - 34778102 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016434`
GeneID	`131016434`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016434`
原始查询	`SmilChr03G002208`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CASP-like protein 4B1
产物	CASP-like protein 4B1
Arabidopsis	`AT2G38480` (AT2G38480) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818430] identity=54.7; qcov=1; evalue=1e-70; confidence=high
Rice	`Os05g0344400` - identity=54; qcov=0.849; evalue=8.64e-59; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016434

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801110.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801110.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801110.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801110.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801110.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:34776619`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A1,B27,B92,C42,C63,C86
`Chr3:34776646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C83
`Chr3:34777362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr3:34777398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,C82
`Chr3:34777421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:34777434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:34777642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B99,C26
`Chr3:34777785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801110.1

192 aa

192

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 45-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801110.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	45	173	1.2e-26	94.0	Casparian strip membrane protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945127.1
CAGAAAAACAACAAAAAACGAAGAAGCAATAATTTTGGATTTTGGCACACCAACAATATTACATGTAAATTGTAATGATGATACCAATATGAGACATGCTGTAACGAAGAATAAAGAAGCAAAGCTGAGCTGTCAAGTTGAGCAAACCGGTTACAAAAAACACACACTTCTCATAATTTTCTCGTTTATGTAAACTTCCGTTGCTTTTCTTGCACTTCAATTCTTGTTCTGGATTTATCCTAAAATCTCTTTTTCAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016434
ATGACTAAGCCTACTGACGCAAAGCCGGAAGAGGCGCCGCCGCCCGCCGCCGATGTGGAGAACCAGAGGGCGGCGGCTGCTGGCGGCGGAGTGTCCAACATCCTCCAGCGGTGGAGGCGCGAAGGTATTCTGAAGAGGGGCTCCTTGGCTTTTCGCGCCTTCGGTCTTCTCTTCTCTTTGCTGGCTTTCATAATCATGGCTACCAATCAACATGGCGACGGCAGAGAATTTGATAAATATGAAGAATACAGGTATGTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801110.1
MTKPTDAKPEEAPPPAADVENQRAAAAGGGVSNILQRWRREGILKRGSLAFRAFGLLFSLLAFIIMATNQHGDGREFDKYEEYRYVLAIAILSALYTGLQTWKQIHEIYTTREIISRQNASLIDFIGDQLVAYLLLSAASAAVPLTNSMRQGSDNIFTDSSASAISMEFFAFFSLGLSALISGYKLSSQTYI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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