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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002215`

染色体: Chr03 坐标: 34901724-34903433 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002215`
名称	SmilChr03G002215
描述	uncharacterized SmilChr03G002215
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	34901724 - 34903433 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016440`
GeneID	`131016440`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016440`
原始查询	`SmilChr03G002215`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=25.5; qcov=0.739; evalue=1.32e-07; confidence=low
Rice	`Os02g0328500` - identity=29.7; qcov=0.505; evalue=2.17e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016440

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801115.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801115.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801115.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801115.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057801115.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:34901957`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	B103,B119,B128,B13,B133,B18,B35,B6,B70,B8,B81,B85,B87,C10,C22,C27,C31,C39,C41,C47,C49,C52,C55,C57,C67,C69,C70,D4,D8
`Chr3:34901976`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	66	A1,A10,A14,A15,A2,A3,A4,A5,A6,A9,B10,B102,B117,B124,B127,B13,B130,B132,B136,B139,B15,B16,B20,B23,B29,B3,B30,B31,B34,B4,B41,B44,B48,B55,B56,B70,B71,B72,B73,B77,B84,B85,B88,B89,B9,B96,C15,C24,C29,C3,C39,C45,C49,C52,C54,C57,C59,C70,C71,C81,C86,C9,D2,D4,D8,D9
`Chr3:34901986`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A22,A9,B22,C16,C62,C71,C79
`Chr3:34901990`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A22,A9,B22,C16,C62,C71,C79
`Chr3:34902001`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr3:34902001`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C62
`Chr3:34902014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr3:34902066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:34902119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr3:34902150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:34902172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:34902175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801115.1

287 aa

144

287

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 25-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801115.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	25	121	4.6e-06	28.2	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945132.1
TTTTGGAGCTATTATATACTCCAACAGTCGCGAGGACTGTTCACTCTTCTCAAACTATTCTGATATAAGCAAAACGTTTCTGGAGAAGGATTTACGAAGAATCGCAACCAAGATGGCTTCGAGGCAGCAAGGAAGCAACGACAGCGGCCGTGTCCGTGTTAATAGGACCGACAAAACACGTTGGAGCTGGACCTGTAAGGAGGAGGAAACACTGATAACCTCGCTTAAGGAATTGGTGGTGCAAGGTTGGAATTCGGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016440
ATGGCTTCGAGGCAGCAAGGAAGCAACGACAGCGGCCGTGTCCGTGTTAATAGGACCGACAAAACACGTTGGAGCTGGACCTGTAAGGAGGAGGAAACACTGATAACCTCGCTTAAGGAATTGGTGGTGCAAGGTTGGAATTCGGATAACGGTTTTAGGGCTGGGTATCTCGCAAAACTGGAGGATGCAATGAGGCAAGTATTTCCAGATACTGACTTGAAGGGAAATCCGCACATCAACTCCAAGATATGTGCGTGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801115.1
MASRQQGSNDSGRVRVNRTDKTRWSWTCKEEETLITSLKELVVQGWNSDNGFRAGYLAKLEDAMRQVFPDTDLKGNPHINSKICAWKKNYYSLSAMLGRSGIGFNANGNHMVDCTNEQWEQIVKCDPNARLMRYKSWPMFEDWKEVFGKDRATGEHAEDLLDALNDMQRRENMNELTPESEYHVNLDGITTTEMIDESVGQSSQETAVGPTGSRKRKPNRDEMSAVCEVLREINRTTAERLANLANRIGYEFDIGKARQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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