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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002221`

染色体: Chr03 坐标: 34983554-35016343 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002221`
名称	SmilChr03G002221
描述	uncharacterized SmilChr03G002221
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	34983554 - 35016343 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016446`
GeneID	`131016446`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016446`
原始查询	`SmilChr03G002221`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Tautomerase/MIF superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831707]; symbol=AT5G01650; hit=AT5G01650; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Tautomerase/MIF superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831707]; symbol=AT5G01650; hit=AT5G01650; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G01650` (AT5G01650) Tautomerase/MIF superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831707] identity=79.1; qcov=1; evalue=1.92e-64; confidence=high
Rice	`Os12g0107500` - identity=73.9; qcov=1; evalue=3.51e-63; confidence=high
GO	GO:0005615 (GO:0005615); GO:0050178 (phenylpyruvate tautomerase activity)
KEGG	smil00350 (Tyrosine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00360 (Phenylalanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01187 (MIF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016446

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801125.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057801125.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057801125.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801126.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801126.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:34983879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B112,B82
`Chr3:34983884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:34983892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C58
`Chr3:34985011`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B42,B43,B59,B9,B90,B98
`Chr3:34985037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B59,B9,B90
`Chr3:34985316`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A8,B5,B57,B72,C51
`Chr3:34985316`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A8,B5,B57,B72,C51
`Chr3:34985324`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A11,A15,A22,A3,A4,A7,A9,B108,B109,B11,B115,B130,B21,B23,B24,B52,B57,B7,B75,B76,B80,B89,B93,C13,C19,C21,C36,C49,C53,C60,C61,C72,C78,C83
`Chr3:35016067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C27
`Chr3:35016069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B94,C32,C68
`Chr3:35016069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C32,C68
`Chr3:35016075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801125.1

121 aa

121

MIF

PF01187 MIF 1-107 aa

XP_057801126.1

115 aa

115

MIF

PF01187 MIF 1-115 aa

XP_057801127.1

115 aa

115

MIF

PF01187 MIF 1-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801125.1`	Pfam	`PF01187`	MIF	Domain	1	107	1.3e-19	71.4	Macrophage migration inhibitory factor (MIF)
`XP_057801126.1`	Pfam	`PF01187`	MIF	Domain	1	115	1.7e-23	83.8	Macrophage migration inhibitory factor (MIF)
`XP_057801127.1`	Pfam	`PF01187`	MIF	Domain	1	115	1.7e-23	83.8	Macrophage migration inhibitory factor (MIF)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945144.1
CTCTACTATAGGGGTGGATATGCACTTTTCCTAAAATAATTCGATCAAATTCAATTGGGCTTGAGATCAAGTCGGATTCAAATCTGGACGGGATCCGGCCCGCTGCGCCTAAAACGAAAAATCCTCATACTTGAATTAGTGACAGTGAAAATATTACTAGCACATTTTTCCCACTAATTTAAAGAAAAAGGGTTGAATTTCAGCATTCTAGAGTTGTGGTGTTTGGATATCAAATTAGAGTCGCAGAGCTAAGCAAGGGT...

XM_057945143.1
TTTCCTAAAATAATTCGATCAAATTCAATTGGGCTTGAGATCAAGTCGGATTCAAATCTGGACGGGATCCGGCCCGCTGCGCCTAAAACGAAAAATCCTCATACTTGAATTAGTGACAGTGAAAATATTACTAGCACATTTTTCCCACTAATTTAAAGAAAAAGGGTTGAATTTCAGCATTCTAGAGTTGTGGTGTTTGGATATCAAATTAGAGTCGCAGAGCTAAGCAAGGGTTTACCGGAACGAATCCATGCCGTGCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131016446
ATGCCGTGCTTGAACATTTCCACTAACGTCAGCCTCGAGGCCACCGACACTTCTGCCATACTCTCCGAGATCTCCTCCACCGTTGCCAAGCTCATCGGCAAACCCGAGGCTTATGTGATGGTTGTGTTGAAGGGATCTGTCCCCATATCATTTGGAGGGACAGAGCAGCCTGCTGCTTATGGAGAGCTTGTTTCAATTGGAGGGCTTAGTCCTGATGTCAACAAGAAGATCAGTGGTGCTATTGCCGACATACTTGAGAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057801125.1
MPCLNISTNVSLEATDTSAILSEISSTVAKLIGKPEAYVMVVLKGSVPISFGGTEQPAAYGELVSIGGLSPDVNKKISGAIADILETKLSVPKARYFLKFYDTKASQSQEYAQCLHALHQF

XP_057801126.1
MPCLNISTNVSLEATDTSAILSEISSTVAKLIGKPEAYVMVVLKGSVPISFGGTEQPAAYGELVSIGGLSPDVNKKISGAIADILETKLSVPKARYFLKFYDTKGSNFGWNGSTF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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