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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002226`

染色体: Chr03 坐标: 35074596-35075645 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002226`
名称	SmilChr03G002226
描述	PRA1 family protein B4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	35074596 - 35075645 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016449`
GeneID	`131016449`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016449`
原始查询	`SmilChr03G002226`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PRA1 family protein B4-like
产物	PRA1 family protein B4-like
Arabidopsis	`AT2G38360` (PRA1.B4) prenylated RAB acceptor 1.B4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818416] identity=57.7; qcov=0.933; evalue=2.1e-80; confidence=high
Rice	`Os05g0474400` (OsPRA1) - identity=55.8; qcov=0.771; evalue=3.26e-59; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF03208 (PRA1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016449

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057801130.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057801130.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057801130.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057801130.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057801130.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:35074952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:35075001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:35075016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr3:35075100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr3:35075178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B37,B81,C42,C6
`Chr3:35075332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B112,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801130.1

223 aa

112

223

PRA1

PF03208 PRA1 51-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801130.1`	Pfam	`PF03208`	PRA1	Family	51	194	3.8e-49	166.7	PRA1 family protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945147.1
AAATGAAAATAAGTAGTAATTCGTAAGTATCGGAATCGGAGTATCCAACTCACATAGATCCACCGACGCAATATCCTCCAATTTCTCCCCCAAACCGTACTCGCAAAGTTAAAACAAATTCAAACCCCCTTTCCCAAACGCTCCGTATAAATACTCCTTCCTCTTCGCTCCTTCAAATTTGCCGAAAAATAATCCCCCAAATTTCCTCAATAACATGGCTGCAGGCGCAAATTCCTCCCCCGCGATCCTCCCCATCTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016449
ATGGCTGCAGGCGCAAATTCCTCCCCCGCGATCCTCCCCATCTCCAATGCCGCCGCGCAGCCGCCCACCGCTGCTGGAAATCAGCAATTGTCCTCCAATTCCTCCGTCCGCTTGTTCCTCACCGCCATCTCCGACAACATTCGATTCGGCCTCGCCAACCGCCGCCCCTGGTCGGAGGTCGTCGATCGCTCCGCCTTCTCCAAGCCGGAATCGATCTCCGAAGCCACTCTCCGATTGAGGAAGAACTACAACTACTTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801130.1
MAAGANSSPAILPISNAAAQPPTAAGNQQLSSNSSVRLFLTAISDNIRFGLANRRPWSEVVDRSAFSKPESISEATLRLRKNYNYFRTNYLTIVTAVLAFSLLTNPFSLILLSGLLAAWLFLYVFRQASDPPIVFFGRQYSDRETLLFLIVSTVAVIFLTSVGSVLVSALMIGVAVVSLHGAFRAPEDLFLDEQEPQGGVPGFLTLLSGGAVATSQAPMPARA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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