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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002227`

染色体: Chr03 坐标: 35094112-35096951 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002227`
名称	SmilChr03G002227
描述	uncharacterized SmilChr03G002227
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	35094112 - 35096951 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016450`
GeneID	`131016450`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016450`
原始查询	`SmilChr03G002227`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone acetyltransferase of the GNAT family 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824626]; symbol=HAG1; hit=AT3G54610; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	histone acetyltransferase of the GNAT family 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824626]; symbol=HAG1; hit=AT3G54610; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G54610` (HAG1) histone acetyltransferase of the GNAT family 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824626] identity=82.6; qcov=0.261; evalue=3.52e-07; confidence=weak
Rice	`Os10g0415900` (OsHAG702) - identity=90; qcov=0.227; evalue=9.26e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016450

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801131.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801132.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057801133.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801131.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:35094535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr3:35094538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:35094558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr3:35094572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B55,C50
`Chr3:35094587`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	98	A13,A19,A2,A21,A3,A5,A9,B1,B10,B101,B103,B108,B114,B119,B12,B121,B13,B133,B134,B135,B14,B18,B19,B2,B22,B25,B27,B3,B32,B33,B34,B37,B39,B41,B5,B51,B54,B6,B61,B64,B68,B69,B7,B70,B71,B78,B8,B81,B82,B84,B86,B87,B88,B91,B97,C1,C10,C11,C13,C14,C16,C17,C22,C23,C27,C29,C3,C33,C34,C36,C39,C40,C42,C43,C46,C47,C48,C49,C53,C55,C57,C59,C6,C67,C69,C70,C74,C79,C80,C81,C82,C84,D1,D10,D2,D4,D7,D8
`Chr3:35094590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B44
`Chr3:35094623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B37,B81,C42,C6
`Chr3:35094624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B37,B81,C42,C6
`Chr3:35094636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr3:35094637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,C27
`Chr3:35094641`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A23,B128,C21,C45,C65,D7,D8
`Chr3:35094657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099004.1
TCTCTTCCTTTCTCTGCGTCGACCACCACCTCCATTTCCCTATCCGCGACGATTCGACCCACCGGCCGATGCCACCTCCATTTTCCCCTCCCTCTGCCGGCGATTCGACTCACCGGCCGCGGCCGCGATCTGCCACCTTTCGCCGCCTCCTAGAGATCTGCTATTCCACCTTCTTCGATGCCACCTCCATTTTCCCCTCCCCCCTCCGGCGATTCGACTCACCGGCCGCATTCCACCGCGATTCGCAACGATGAGATCTG...

XM_057945149.1
TCTCTTCCTTTCTCTGCGTCGACCACCACCTCCATTTCCCTATCCGCGACGATTCGACCCACCGGCCGATGCCACCTCCATTTTCCCCTCCCTCTGCCGGCGATTCGACTCACCGGCCGCGGCCGCGATCTGCCACCTTTCGCCGCCTCCTAGAGATCTGCTATTCCACCTTCTTCGATGCCACCTCCATTTTCCCCTCCCCCCTCCGGCGATTCGACTCACCGGCCGCATTCCACCGCGATTCGCAACGATGAGATCTG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131016450
ATGAGATCTGCCCCTTCCACAGTTCTACCTTCTGATTCGAGGTCCGGCGAAGGCCGCCTCTTTGAGATTTCCGGCGCGAATCGCTGCGCCCCTAGATCCCCAAATCCTCACCGCCTCTTTGCGATTTTCGGCGACCACGGCAGCCATGGCCGCCGATCTGCCCCTCCCACCACCAGAAAACCAGAAATCGATCTGCCACCTCCCTTCCCCCTATGGTGCCTGGTCCAGAACCGCCGCTCGCCAGCCGCTGTGTTGCAGTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057801131.1
MRSAPSTVLPSDSRSGEGRLFEISGANRCAPRSPNPHRLFAIFGDHGSHGRRSAPPTTRKPEIDLPPPFPLWCLVQNRRSPAAVLQSPTPILTSTVSSPISLTLIFSYVNRLFSGVSTSYSLFFMLLSWMGSNPLLALLL

XP_057801132.1
MRSAPSTVLPSDSRSGEGRLFEISGANRCAPRSPNPHRLFAIFGDHGSHGRRSAPPTTRKPEIDLPPPFPLWCLVQNRRSPAAVLQSPTPILTSTADRIEKHLCQATS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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