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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002228`

染色体: Chr03 坐标: 35107368-35109860 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002228`
名称	SmilChr03G002228
描述	mitochondrial inner membrane protease ATP23-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	35107368 - 35109860 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016451`
GeneID	`131016451`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016451`
原始查询	`SmilChr03G002228`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial inner membrane protease ATP23-like
产物	mitochondrial inner membrane protease ATP23-like
Arabidopsis	`AT3G03420` (AT3G03420) Ku70-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821258] identity=68.3; qcov=0.68; evalue=5.67e-51; confidence=high
Rice	`Os12g0288900` - identity=60.6; qcov=0.68; evalue=1.28e-44; confidence=medium
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0031314 (extrinsic component of mitochondrial inner membrane); GO:0033615 (mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex assembly); GO:0034982 (mitochondrial protein processing)
KEGG	-
Pfam	PF09768 (Peptidase_M76)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016451

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057801134.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057801134.1`
3	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.40000	`XP_057801134.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057801134.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801134.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:35107810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr3:35107816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr3:35107868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr3:35108102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr3:35108141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:35108286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:35108318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B33,C23,C72
`Chr3:35108337`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A5,B1,B101,B135,B58,B7,B78,B8,C42
`Chr3:35108341`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A19,A6,B102,B103,B111,B134,B137,B16,B29,B30,B36,B41,B50,B52,B60,B61,B70,B85,C15,C17,C30,C35,C5,C50,C6,C61,C7,C75,C76,D11,D9
`Chr3:35108360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B85
`Chr3:35108360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:35108375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801134.1

153 aa

153

Peptidase_M76

PF09768 Peptidase_M76 47-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801134.1`	Pfam	`PF09768`	Peptidase_M76	Family	47	152	1.5e-36	126.5	Peptidase M76 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945151.1
AAAGTGAAAAAGTGCAGCTGAAGAGAATAGAGAACAAAATTAATCGGCAGGTGACCTTCTCCAAGTGGCGATCGGGTCTTCTAAAAAAAGCTCATGAGATTTCCATCCTCTGCGACGCCAATGCCGGCTTAATCGTCTTCTCCACCAAAGGTATATTGAACTGCATTCTTGATACAAGCAAGATAGAAGCCGGGAAGATGCAGCTTGAGGAGCAAGTGTTCGATGTGGAGCAGCTTCTGGAGGACGTGGTTGATCTATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016451
ATGCAGCTTGAGGAGCAAGTGTTCGATGTGGAGCAGCTTCTGGAGGACGTGGTTGATCTATACTATCCTGTTGGCATGAATAAAGGCGTAGACGTGATCTTGGATCCGTGCGATGGCTCTGTCTCGAGATGTCGTTCGGCTAAAGATGATCAGGTGGTGCAAGTGGTGATTCATGAGCTCGTTCATGCTTATGATGAGTGTCGTGCTGCTAATCTCGACTGGACTAACTGCGCTCATCACACTTGCAATGAGATTCGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801134.1
MQLEEQVFDVEQLLEDVVDLYYPVGMNKGVDVILDPCDGSVSRCRSAKDDQVVQVVIHELVHAYDECRAANLDWTNCAHHTCNEIRANHLSGYCHLKQEFLRGHLKIKGGQECVWQRAMKAMSGNPYCSGIKAEDAMKAVWSTCYNDITPFDT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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