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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002243`

染色体: Chr03 坐标: 35384450-35388237 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002243`
名称	SmilChr03G002243
描述	protein TIC 56, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	35384450 - 35388237 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016464`
GeneID	`131016464`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016464`
原始查询	`SmilChr03G002243`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIC 56, chloroplastic
产物	protein TIC 56%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G01590` (AT5G01590) histone-lysine N-methyltransferase ATXR3-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830369] identity=73; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14237 (GYF_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016464

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057801141.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057801141.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801141.1`
4	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057801141.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057801141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:35384760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,C27
`Chr3:35385524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr3:35386790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:35386973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,C27
`Chr3:35387654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:35387840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr3:35387989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801141.1

501 aa

250

501

GYF_2

PF14237 GYF_2 235-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801141.1`	Pfam	`PF14237`	GYF_2	Domain	235	282	7.4e-11	42.4	GYF domain 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945158.1
CAACAATCTCGGAAAAGGCCGCCTTATTAAAAGAAACTGTATATTACCGTAGGAAAGTAAAAGGAGAAAGAGCCTCCTCTCTCCCTCTCCTCATCCAATTTCGCAGCTCTCAGTCCACGCTCCGTCCACTGTCACGGTCACCCTCCCTCTGCGGTTCGCAGAATACGCATTTTTTCTATTTTTCCTCATTTCGAAGAACAGCACGCAGCAATAGTGCGTCAATGGCGTCGATAAATTTCAACCCGTTTGGTGACAACTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016464
ATGGCGTCGATAAATTTCAACCCGTTTGGTGACAACTGGTTCAAATTCTCGCGGAAGCTCCCAATCCCACCAATCAACCTCGTGTCCTCGCTCTTCAAACCCCATGGAAGAGCCCCCAACTTCGCCGCCATTTCGAACCCTTTTTCGAAGAAACCGCAGCCCGAGCCCGATGAGAAGCCTGGCAAGTACACGCAAATGTTGGAGCAGTTCTACTGGGAGTGCGAGAATTTACCGGATTATCGACACAGGCCAGAGGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801141.1
MASINFNPFGDNWFKFSRKLPIPPINLVSSLFKPHGRAPNFAAISNPFSKKPQPEPDEKPGKYTQMLEQFYWECENLPDYRHRPEVEKILQEDPIVEKKENPTQEEIEENERWWAEFRSSPVMQFLTRAEEIADKLNEMELQENSVPYKNEDKKYWQAVPNVIGLDGRPMPRKAIKTRRESDDKFWDFARQFFFGLWGFRQRPYPPGRPIDVAQAIGYKALERRYYDFIMKTGGWFYKDRLGRTRGPMELIQLKTAWGAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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