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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002244`

染色体: Chr03 坐标: 35396983-35399260 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002244`
名称	SmilChr03G002244
描述	kinetochore protein SPC24 homolog
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	35396983 - 35399260 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016467`
GeneID	`131016467`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016467`
原始查询	`SmilChr03G002244`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	kinetochore protein SPC24 homolog
产物	kinetochore protein SPC24 homolog
Arabidopsis	`AT3G08880` (AT3G08880) plectin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820036] identity=42.7; qcov=0.955; evalue=1.01e-52; confidence=medium
Rice	`Os04g0445400` - identity=36.6; qcov=0.925; evalue=2.45e-40; confidence=medium
GO	GO:0051983 (regulation of chromosome segregation)
KEGG	-
Pfam	PF08286 (Spc24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016467

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801151.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057801151.1`
3	Centromere	着丝粒	1.00000	`XP_057801151.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057801151.1`
5	Spindle	Spindle	0.20000	`XP_057801151.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:35397326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr3:35397363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B117
`Chr3:35397405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B51,B59,C15
`Chr3:35398154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B13,B53,C45,C73
`Chr3:35398383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:35398851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801151.1

201 aa

100

201

Spc24

PF08286 Spc24 87-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801151.1`	Pfam	`PF08286`	Spc24	Family	87	196	6.1e-08	33.6	Spc24 subunit of Ndc80

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945168.1
TCAAATCACTCTTCGCTCCATTGCCTAAAAAAAAAGAAGAGATAGAAGAAGTCACTCTCCGCTCCAAAAACCTGTAAAATTTCCTGTTTGACCCTAATTTCGAAATTCCCCAAGTTACAGAATTTTCCCTCTCTTCTCCGCCCTCTCTCCATTTCTCCAACTCTTCCCCGATCAGATCTCAGTTTGCGTAAGTTCTATTAATTTTCATTGGAACCACCAACAATTGAGAATCTGGAACCCTAGTTTTCCAACCAGCTAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016467
ATGGAGGTGCCACCAAAAGCATTCAAAACTGAAGAGTTGATTAATTACAGCAACAACTTGATAGATGTATTGAAAGAAGAGAAGGATACTGCAAATCTCAGGCATTTTCTCCTTCAAGCCAGTGCCCTTCAATCCCAGTGTGACAAAGACTTCACTGAAGTTCAGAAATCTATTGAAGATTATGAAAATAAGATTCATATATGCAAGCAGAAAGCAGCAGCTGCAGAATCTGAGAGCGCCGCTGATGCAGAACTTGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801151.1
MEVPPKAFKTEELINYSNNLIDVLKEEKDTANLRHFLLQASALQSQCDKDFTEVQKSIEDYENKIHICKQKAAAAESESAADAELDFLQKELEEEQNQERQLREELREIVNEIDDLEHKRETVEEQRRTMKKFEQDEVRAQMKLSMYASVTNTIPYLDNPSRISGHIVDREKKVVETFEFDPSTATTFDTCNSIWKMINSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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