当前解析结果
SmilChr03G002248| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002248 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002248 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002248 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 35410575 - 35412657 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016471 |
|---|---|
| GeneID | 131016471 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016471 |
| 原始查询 | SmilChr03G002248 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016471 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801156.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801156.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801156.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057801156.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057801156.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:35411318 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr3:35412216 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B127,B40,C58 |
Chr3:35412241 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B11,B31,B82 |
Chr3:35412265 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B101,B125,C16,C22 |
Chr3:35412277 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B82 |
Chr3:35412277 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B82 |
Chr3:35412352 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 19 | A2,B1,B101,B104,B108,B139,B28,B40,B42,B47,B58,C22,C61,C65,C68,C83,D10,D11,D6 |
Chr3:35412368 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A19,C9 |
Chr3:35412368 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | A19,C9 |
Chr3:35412401 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B40,C58 |
Chr3:35412401 |
A |
AG |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B40,C58 |
Chr3:35412405 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C33,D3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。