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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002250`

染色体: Chr03 坐标: 35428730-35431069 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002250`
名称	SmilChr03G002250
描述	50S ribosomal protein L21, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	35428730 - 35431069 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016468`
GeneID	`131016468`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016468`
原始查询	`SmilChr03G002250`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein L21, mitochondrial-like
产物	50S ribosomal protein L21%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT4G30930` (NFD1) Ribosomal protein L21 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829217] identity=50; qcov=1; evalue=2.11e-70; confidence=high
Rice	`Os05g0557800` - identity=84.1; qcov=0.496; evalue=3.95e-68; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00829 (Ribosomal_L21p)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016468

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057801152.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801152.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801152.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801152.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801152.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:35429046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,C27
`Chr3:35429215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:35430090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B97,C14,C20,C37
`Chr3:35430148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:35430282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,C27
`Chr3:35430316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:35430448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:35430561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801152.1

266 aa

133

266

Ribosomal_L21p

PF00829 Ribosomal_L21p 134-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801152.1`	Pfam	`PF00829`	Ribosomal_L21p	Family	134	234	1.8e-33	115.4	Ribosomal prokaryotic L21 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945169.1
TTTGGTGGACCGAGAGAGTACTATTTTAAATCAAAACAAAAGATTTTGAAAAAACCCTACGAACTACTCGCTGCTGCGCCGTCCACACTCCACACGCTTCTCCCTCTCCGGCCTCCCCTCCGCCGCCAGCATATCGGCGCCGCCAGCAACAGCAGCTCCCTCGGCCGCCAGCATCTCCCCTGCGCCATTCTCCCTTGCTCTCCTTCCTTCACCGTCGAAGCACATCACCCGGCCCCCCCACCAATAGCTAGTTCGGTCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016468
ATGGCGAATCGGCGTTGCTTTCAAACCCTAACCCGCTGTCTCCAGTCCATCAAAACCCTAACCCCTCTCTCGGAGGCCATAGCGCCTTTCTCCGTTTATGCCCTCAACCAAACCATCGCCGCCACACCCCCAAACTACATTTTCGTTAATAATGTTAACGTTTACCAACGCGCCGCAGTGCCCACGCGTAACTTTAACTCGAGCCCCACCGACAGCGACGATGTCGAGGAGGATGACGAGGAAGATTACGAAAGCGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801152.1
MANRRCFQTLTRCLQSIKTLTPLSEAIAPFSVYALNQTIAATPPNYIFVNNVNVYQRAAVPTRNFNSSPTDSDDVEEDDEEDYESEEEDDIENEEESAVLSAEDKKIEAAEIGYTVMGPLQKSDRVFKLYEPVFAVVQIGSHQFKVSNGDTIYTERLKHCDVNDKLVLNKVLMLGSQTQTIIGRPILPDAAVHAVVEEHALDAKVIIFKKKRRKNYRRTKGHRQELTKLRITDIEGIEKPENTMPLPSSPKKETEKKPEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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