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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002259`

染色体: Chr03 坐标: 35581768-35582496 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002259`
名称	SmilChr03G002259
描述	uncharacterized SmilChr03G002259
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	35581768 - 35582496 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018713`
GeneID	`131018713`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018713`
原始查询	`SmilChr03G002259`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G51760; symbol=AT3G51760; hit=AT3G51760; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G51760; symbol=AT3G51760; hit=AT3G51760; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G51760` (AT3G51760) - identity=32.1; qcov=0.992; evalue=2.01e-16; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05097 (DUF688)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018713

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057803406.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803406.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803406.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803406.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803406.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:35581840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B66,D2
`Chr3:35582051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,A22,C34,C63,C67
`Chr3:35582071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,D8
`Chr3:35582173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B11,B89,C21
`Chr3:35582176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B112,B117,B82,B9
`Chr3:35582276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr3:35582317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr3:35582323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B24,B46
`Chr3:35582381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr3:35582383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C58
`Chr3:35582395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,B97,C46,C53
`Chr3:35582401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B112,B82,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803406.1

242 aa

121

242

DUF688

PF05097 DUF688 41-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803406.1`	Pfam	`PF05097`	DUF688	Family	41	179	2.5e-11	44.2	Protein of unknown function (DUF688)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947423.1
ATGGAGGAAACCAAGAATCAGATTGTGCACAGGAAGCTGAACTTGAACGTGCCACCTCTATCGACGAGGCGCGCCTCCGGTGGCACCGCTATCTCCGGTTCGAGGCTTGACCCGGCCAACATGGTGCCCTTCTCGTGGGAACGAATCCCGGGCGAGCCAAAGGACCAGCCTACGATCGAGGGCAATGACCGGCCGCCACCCCCAAAGCCACCCCCCGCCCGGTGGCGACCCTCTGTTAGGGTTGATGACCTTGATCATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018713
ATGGAGGAAACCAAGAATCAGATTGTGCACAGGAAGCTGAACTTGAACGTGCCACCTCTATCGACGAGGCGCGCCTCCGGTGGCACCGCTATCTCCGGTTCGAGGCTTGACCCGGCCAACATGGTGCCCTTCTCGTGGGAACGAATCCCGGGCGAGCCAAAGGACCAGCCTACGATCGAGGGCAATGACCGGCCGCCACCCCCAAAGCCACCCCCCGCCCGGTGGCGACCCTCTGTTAGGGTTGATGACCTTGATCATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803406.1
MEETKNQIVHRKLNLNVPPLSTRRASGGTAISGSRLDPANMVPFSWERIPGEPKDQPTIEGNDRPPPPKPPPARWRPSVRVDDLDHDGSGGGGEENSHSDRFDIFSLAESVDDVEGYCKATKDRSSKLLAESVDDVEGFCKTTKDRSSTVLETNSDDCCSSNFIIERFLPDAQALAEESVMNKKIPFSDSSFSRAISIGRSHQSMKGCGLGSLLPWKMKPKSCKVKSPVCDTIIGANLKQKR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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