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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002262`

染色体: Chr03 坐标: 35615619-35619293 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002262`
名称	SmilChr03G002262
描述	transcription repressor KAN1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	35615619 - 35619293 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016480`
GeneID	`131016480`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016480`
原始查询	`SmilChr03G002262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription repressor KAN1-like
产物	transcription repressor KAN1-like
Arabidopsis	`AT2G40260` (AT2G40260) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818618] identity=59.5; qcov=0.475; evalue=3.4e-37; confidence=medium
Rice	`Os06g0543200` - identity=53.3; qcov=0.471; evalue=1.57e-31; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016480

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801168.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801168.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801168.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801168.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057801168.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:35615699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:35616309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr3:35616414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr3:35616649`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B10,B26,B3,B38,B39,B47,C22,C41,C56,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801168.1

264 aa

132

264

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 49-100 aa

XP_057801169.1

255 aa

128

255

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 49-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801168.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	49	100	1.2e-06	29.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057801169.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	49	100	1.1e-06	29.3	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945185.1
ATGGAAGGAAGTGATGAGACAGAATGTTCTAGAACAAGCCTTTGCGAGGAAAACGATGAGGAGGAGGAAGCAAGCAACAAGTCAAGCTATAGCAGAGAGAAGAAGCCGCCAACGATTAGGCCTTACGTCCGATCGAAAACGCCGCGGCTGCGGTGGACGCCCGATCTTCATCGCCGCTTTCTGCAAGCTGTGGAAACACTTGGTGGATTGGACAGAGCTACACCAAAATTAGTGCTTCAATTCATGAATATGAGAGAGCT...

XM_057945186.1
ATGGAAGGAAGTGATGAGACAGAATGTTCTAGAACAAGCCTTTGCGAGGAAAACGATGAGGAGGAGGAAGCAAGCAACAAGTCAAGCTATAGCAGAGAGAAGAAGCCGCCAACGATTAGGCCTTACGTCCGATCGAAAACGCCGCGGCTGCGGTGGACGCCCGATCTTCATCGCCGCTTTCTGCAAGCTGTGGAAACACTTGGTGGATTGGACAGAGCTACACCAAAATTAGTGCTTCAATTCATGAATATGAGAGAGCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016480
ATGGAAGGAAGTGATGAGACAGAATGTTCTAGAACAAGCCTTTGCGAGGAAAACGATGAGGAGGAGGAAGCAAGCAACAAGTCAAGCTATAGCAGAGAGAAGAAGCCGCCAACGATTAGGCCTTACGTCCGATCGAAAACGCCGCGGCTGCGGTGGACGCCCGATCTTCATCGCCGCTTTCTGCAAGCTGTGGAAACACTTGGTGGATTGGACAGAGCTACACCAAAATTAGTGCTTCAATTCATGAATATGAGAGAGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801168.1
MEGSDETECSRTSLCEENDEEEEASNKSSYSREKKPPTIRPYVRSKTPRLRWTPDLHRRFLQAVETLGGLDRATPKLVLQFMNMRELNIAHVKSHLQMYRSKQIDEHSYQGRGMSDNGFFLGAVEHQNMFNLRQLPLLPSFHQRRLSIFSHNYRSQINLDFGPRRKEEDMKEEFGLLHKLDDHIYFTSSNLAQHRVDHEQMTCLERRESGMKRKELDLNLSLGKESRNDVRQSSISSPNSVLIYKKLKQDFGNARGSSTL...

XP_057801169.1
MEGSDETECSRTSLCEENDEEEEASNKSSYSREKKPPTIRPYVRSKTPRLRWTPDLHRRFLQAVETLGGLDRATPKLVLQFMNMRELNIAHVKSHLQMYRSKQIDEHSYQGRGAVEHQNMFNLRQLPLLPSFHQRRLSIFSHNYRSQINLDFGPRRKEEDMKEEFGLLHKLDDHIYFTSSNLAQHRVDHEQMTCLERRESGMKRKELDLNLSLGKESRNDVRQSSISSPNSVLIYKKLKQDFGNARGSSTLDLTL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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