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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002265`

染色体: Chr03 坐标: 35647641-35648105 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002265`
名称	SmilChr03G002265
描述	RING-H2 finger protein ATL40-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	35647641 - 35648105 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018715`
GeneID	`131018715`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018715`
原始查询	`SmilChr03G002265`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL40-like
产物	RING-H2 finger protein ATL40-like
Arabidopsis	`AT2G42350` (AT2G42350) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818836] identity=45.8; qcov=0.623; evalue=4.2e-20; confidence=low
Rice	`Os01g0755700` - identity=39.8; qcov=0.831; evalue=1.89e-23; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12678 (zf-rbx1); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018715

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057803407.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057803407.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057803407.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057803407.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803407.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:35647803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B125,B13,B53,C73
`Chr3:35647914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr3:35647944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B5,B57,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803407.1

154 aa

154

zf-RING_11

zf-C3HC4_2

zf-RING_2

zf-C3HC4

zf-rbx1

PF17123 zf-RING_11 90-119 aa PF13923 zf-C3HC4_2 90-132 aa PF13639 zf-RING_2 90-133 aa PF00097 zf-C3HC4 91-132 aa PF12678 zf-rbx1 103-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803407.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	90	119	3.8e-10	40.0	RING-like zinc finger
`XP_057803407.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	90	132	2.6e-08	34.3	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057803407.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	90	133	3.8e-14	53.4	Ring finger domain
`XP_057803407.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	91	132	2.7e-06	27.9	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057803407.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	103	133	7.1e-09	36.5	RING-H2 zinc finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947424.1
ATGGCTTCCCAAAATTTTGAGCCCATCCATTTCCCCGACTTGAGAGACAAGATCGACACCAAAAAAAACCCCCTCCTCGGCTCACTCTTCCTCTTCTTCGTCTTCTTCATCACCTTCCTCTTCGTCTACTTCATCTACGTCTGCGCCCGCCGCCGCCACGACGCCGCCGCCAGCCCAGACTCCAACGCGCCGCCGCCGGGCCTAGACCCGGCCACCATCAGCTCCCTCCCCGTCTCCTCCTACGGCAAGAAGCCGAGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018715
ATGGCTTCCCAAAATTTTGAGCCCATCCATTTCCCCGACTTGAGAGACAAGATCGACACCAAAAAAAACCCCCTCCTCGGCTCACTCTTCCTCTTCTTCGTCTTCTTCATCACCTTCCTCTTCGTCTACTTCATCTACGTCTGCGCCCGCCGCCGCCACGACGCCGCCGCCAGCCCAGACTCCAACGCGCCGCCGCCGGGCCTAGACCCGGCCACCATCAGCTCCCTCCCCGTCTCCTCCTACGGCAAGAAGCCGAGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803407.1
MASQNFEPIHFPDLRDKIDTKKNPLLGSLFLFFVFFITFLFVYFIYVCARRRHDAAASPDSNAPPPGLDPATISSLPVSSYGKKPSHGAECAICLSLFQECDKVKVLPLCRHGFHSDCVDEWLRTRSSCPLCRGCVHRVDSLGREFEPGMWMVP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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