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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002278`

染色体: Chr03 坐标: 35964157-35965836 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002278`
名称	SmilChr03G002278
描述	uncharacterized SmilChr03G002278
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	35964157 - 35965836 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018720`
GeneID	`131018720`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018720`
原始查询	`SmilChr03G002278`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=28.5; qcov=0.483; evalue=4.93e-27; confidence=low
Rice	`Os09g0268800` - identity=24.2; qcov=0.354; evalue=1.81e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018720

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803410.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803410.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057803410.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057803410.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803410.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:35964166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B36,C15
`Chr3:35964178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A8,B131,B22,B23,B5,B57,B63,B72,B73,B74,B77,B83,B85,C47,C51,C58,C78,C8,C85
`Chr3:35964180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B104,C34,C63,C67
`Chr3:35964191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C15,D11
`Chr3:35964265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B105,C48
`Chr3:35964297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr3:35964409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr3:35964409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:35964424`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C55
`Chr3:35964424`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C55
`Chr3:35964425`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A22,B119,B122,B8
`Chr3:35964425`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A22,B119,B122,B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803410.1

559 aa

280

559

DUF4283

PF14111 DUF4283 143-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803410.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	143	228	8.3e-09	35.8	Domain of unknown function (DUF4283)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947427.1
ATGATTTCGCCGGTGAAAAACCAGCCGGCGGCCGCACCGCCAACTTCTGATAACTCAAGACTGAATCTCCCAGTGGTTTCAAGCAATTTTTCATCGCACTCGCATGCGCCTATTGATAGTAGGACGTTGGATATTACTAACTCGACTAGGGTTTCGGATACAACTACAAAGATGCCCCAGATGGATGTTGAAACCTCGGCAGCCCGTGCAAATCTATCGCCGAAGAGTAGATCTGAAGGAGATGGTGAACATCAAATTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018720
ATGATTTCGCCGGTGAAAAACCAGCCGGCGGCCGCACCGCCAACTTCTGATAACTCAAGACTGAATCTCCCAGTGGTTTCAAGCAATTTTTCATCGCACTCGCATGCGCCTATTGATAGTAGGACGTTGGATATTACTAACTCGACTAGGGTTTCGGATACAACTACAAAGATGCCCCAGATGGATGTTGAAACCTCGGCAGCCCGTGCAAATCTATCGCCGAAGAGTAGATCTGAAGGAGATGGTGAACATCAAATTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803410.1
MISPVKNQPAAAPPTSDNSRLNLPVVSSNFSSHSHAPIDSRTLDITNSTRVSDTTTKMPQMDVETSAARANLSPKSRSEGDGEHQIMKDQAVPQKISYANIIKPTSTRKPDVLVHRYAIIQPVVSNEVISIKILESMYQDRIKQFQHALIGRVLLRKGEKPRLVSDLKKELQMLWQPKSDWKLIPMSKGFYTIKFTTAEDKLNAKRKSSWNLASGTLRLRDWVRNFDPYKEISSICQVWMRIYYLPVEYWTKEIISSIGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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