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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002282`

染色体: Chr03 坐标: 36013189-36013746 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002282`
名称	SmilChr03G002282
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	36013189 - 36013746 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018723`
GeneID	`131018723`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018723`
原始查询	`SmilChr03G002282`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
产物	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
Arabidopsis	`AT3G27473` (AT3G27473) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822369] identity=32.5; qcov=0.665; evalue=4.69e-13; confidence=low
Rice	`Os07g0611200` - identity=32.2; qcov=0.638; evalue=1.1e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018723

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803414.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057803414.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057803414.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803414.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803414.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:36013228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C28
`Chr3:36013228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:36013229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A1,A18,B122,B129,B132,B2,B4,B44,C12,C32,C68,C87,D10,D5
`Chr3:36013275`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B129,B2,B4,C12,D5
`Chr3:36013275`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B129,B2,B4,C12,D5
`Chr3:36013426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B53,B66,C19
`Chr3:36013495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B77,B99,C26,C33
`Chr3:36013525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr3:36013592`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	B113,B118,B123,B125,B127,B138,B24,B36,B37,B46,B51,B59,B91,B95,B98,C15,C45,C50,C60,C82,D6
`Chr3:36013669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C13
`Chr3:36013717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B50,B58
`Chr3:36013718`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B12,B58,B60,B79,C41

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947431.1
ATGGCTGCACCCAGCACCACCAACCATGCCTCACACGGCCAACATCTTCTTTTCCGAACCAACCGGCTGTCGGCTGCGACTCCTCTCACCTACTGTCCCAATGACTCCTTACTTTACGATGTCTACAGATGCATTGTCTGCGACTACTACATACACATAAGCTGCGCAATGCTTCCCAAAAGGATTGTATTCCATGAATACCACCAGCATCCTCTTCATTTGCTCTTCACTGCTACTACTACTCGTGAGTACTTCTGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018723
ATGGCTGCACCCAGCACCACCAACCATGCCTCACACGGCCAACATCTTCTTTTCCGAACCAACCGGCTGTCGGCTGCGACTCCTCTCACCTACTGTCCCAATGACTCCTTACTTTACGATGTCTACAGATGCATTGTCTGCGACTACTACATACACATAAGCTGCGCAATGCTTCCCAAAAGGATTGTATTCCATGAATACCACCAGCATCCTCTTCATTTGCTCTTCACTGCTACTACTACTCGTGAGTACTTCTGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803414.1
MAAPSTTNHASHGQHLLFRTNRLSAATPLTYCPNDSLLYDVYRCIVCDYYIHISCAMLPKRIVFHEYHQHPLHLLFTATTTREYFCEKDIDLKYWMYGCAECKQWFHINCIPSLGYLSKVKFGGTISIPDCHIHDLILTRMLTLPSQRCGHCKQTIQGLQDEMALFCSHCHFWLHFSCARNSLAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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