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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002326`

染色体: Chr03 坐标: 36621499-36622803 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002326`
名称	SmilChr03G002326
描述	uncharacterized SmilChr03G002326
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	36621499 - 36622803 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018733`
GeneID	`131018733`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018733`
原始查询	`SmilChr03G002326`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=47.6; qcov=0.286; evalue=4.18e-28; confidence=weak
Rice	`Os06g0597250` - identity=46.3; qcov=1.03; evalue=3.62e-138; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018733

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803425.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057803425.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803425.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803425.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803425.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:36621547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B137,B46,C21,C81
`Chr3:36621556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B117,B59
`Chr3:36621562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	67	A1,A9,B107,B108,B109,B110,B111,B120,B125,B126,B133,B137,B138,B140,B15,B17,B22,B26,B27,B28,B3,B33,B38,B39,B41,B45,B47,B48,B57,B62,B68,B69,B71,B75,B8,B89,B95,B97,C10,C11,C13,C14,C19,C27,C28,C32,C38,C39,C41,C5,C50,C52,C53,C55,C6,C61,C62,C63,C73,C76,C77,C79,C80,D11,D3,D6,D9
`Chr3:36621572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr3:36621581`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A13,A20,A22,B11,B129,B2,B46,B52,B88,C21,C32,C51,C71,C81,D10,D5,D6
`Chr3:36621583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr3:36621584`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A13,A20,A22,B11,B129,B2,B46,B52,B88,C21,C32,C51,C71,C81,D10,D5,D6
`Chr3:36621586`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A13,A20,A22,B11,B129,B2,B46,B5,B52,B88,C21,C32,C43,C51,C71,C81,D10,D5,D6
`Chr3:36621644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B81,C26,C87
`Chr3:36621647`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B44
`Chr3:36621647`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B44
`Chr3:36621688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	125	A1,A10,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A22,A23,A25,B100,B101,B105,B106,B110,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B124,B127,B128,B131,B132,B133,B137,B138,B140,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B3,B31,B35,B37,B4,B43,B45,B46,B47,B5,B50,B51,B53,B54,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B64,B67,B68,B69,B70,B71,B74,B75,B76,B77,B79,B81,B82,B86,B87,B88,B89,B90,B95,B98,C1,C10,C11,C13,C14,C17,C19,C21,C22,C23,C25,C26,C28,C32,C33,C34,C36,C38,C4,C42,C47,C49,C54,C55,C58,C60,C62,C63,C67,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C77,C78,C80,C87,D1,D2,D3,D4,D5,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803425.1

434 aa

217

434

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 62-101 aa PF04827 Plant_tran 170-368 aa PF13359 DDE_Tnp_4 199-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803425.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	62	101	1.1e-21	76.9	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057803425.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	170	368	2.2e-93	312.3	Plant transposon protein
`XP_057803425.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	199	358	6.1e-09	36.4	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947442.1
ATGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCTTCATCTTCAGATGAATGGGAAGAACGACGTTATCAACAAAATCGTCAAATTGATCGCATTATTGACGATATGCTCATAAACAATCCCAATCTTATTTTAGGAACTTCTTCTTCCACCACTAAAAAAAGGTATTGTGATAGGGAACGTGAAGTTGGTGAGCAACGTTTGATGAGTGATTATTTTGTCCCTAATCCAACGTATACTTCGGAGCTCTTCCGGCGTAGATTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018733
ATGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCTTCATCTTCAGATGAATGGGAAGAACGACGTTATCAACAAAATCGTCAAATTGATCGCATTATTGACGATATGCTCATAAACAATCCCAATCTTATTTTAGGAACTTCTTCTTCCACCACTAAAAAAAGGTATTGTGATAGGGAACGTGAAGTTGGTGAGCAACGTTTGATGAGTGATTATTTTGTCCCTAATCCAACGTATACTTCGGAGCTCTTCCGGCGTAGATTTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803425.1
MSSSSSSSSSSSSDEWEERRYQQNRQIDRIIDDMLINNPNLILGTSSSTTKKRYCDREREVGEQRLMSDYFVPNPTYTSELFRRRFRMQKSLFLRIVDVVTVNDEYFQQRPDCTGRQGLSPLQKCTRAMRVLAYGTATDAVDEYLRMSSTVTRDAVIHFVEGIISCFGDTYLRRPNQQDLHRLLYAGEQRGFSGMIGSIDCMHWEWKKCPTAWAGQYAGRSEKPTIILEAVASYDLWIWHAFFGTPGSCNDINVLHRSPV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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