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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002340`

染色体: Chr03 坐标: 36885893-36888959 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002340`
名称	SmilChr03G002340
描述	putative cyclic nucleotide-gated ion channel 13
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	36885893 - 36888959 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016553`
GeneID	`131016553`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016553`
原始查询	`SmilChr03G002340`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative cyclic nucleotide-gated ion channel 13
产物	putative cyclic nucleotide-gated ion channel 13
Arabidopsis	`AT5G53130` (CNGC1) cyclic nucleotide gated channel 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835393] identity=65.8; qcov=0.531; evalue=7e-22; confidence=medium
Rice	`Os02g0255000` (OsCNGC2) - identity=56.5; qcov=0.483; evalue=3.65e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016553

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057801258.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057801258.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057801258.1`
4	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.20000	`XP_057801258.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801258.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:36886398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B120,C48
`Chr3:36886429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,C38,C77,C84
`Chr3:36886435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr3:36886443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr3:36886577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr3:36886827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,B53,C8
`Chr3:36886861`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B3,C30
`Chr3:36886861`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B3,C30
`Chr3:36886888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C11,C69
`Chr3:36886926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	B105,B121,B129,B135,B15,B21,B26,B28,B49,B61,B64,B69,B70,B79,C20,C34,C38,C51,C56,D9
`Chr3:36886975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:36886976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B124,B18,B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

9 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099065.1
CATTTCCCAAACCCAGAATCCCCACCCTCCCCTCCCCTCCCCTCCCCATTACAGCCTCTGCCCGCCGCCTCTCTCCCTCACTTCTCACACTCACGGCGGCTGCACGCCTCACGCCTGAGAAGCCACCGGCGCCGCCGCAGCAACTGGTGCTCGCTGCAGCCTCACGCGAGCAGAGCAGCGGCAGCAGCATCCCGTGGCCCTCATCTCGCCGTTCTCCAGACAACTCCAGCCTCCCAGCAGCAGCCTCTCGTCGCCCTCAT...

XM_057945280.1
CATTTCCCAAACCCAGAATCCCCACCCTCCCCTCCCCTCCCCTCCCCATTACAGCCTCTGCCCGCCGCCTCTCTCCCTCACTTCTCACACTCACGGCGGCTGCACGCCTCACGCCTGAGAAGCCACCGGCGCCGCCGCAGCAACTGGTGCTCGCTGCAGCCTCACGCGAGCAGAGCAGCGGCAGCAGCATCCCGTGGCCCTCATCTCGCCGTTCTCCAGACAACTCCAGCCTCCCAGCAGCAGCCTCTCGTCGCCCTCAT...

CDS

8 records

下载 CDS FASTA

LOC131016553
ATGAGGGTGAAAAGACGAGATGCAGAGCAATGGATGTCTCGCTGTCTTCTTCCAGAGAGTTTGAGGCAGCGGATACAAATATACAAATGGCAGGAAATTAGAGGTGTCGATGAAGATAATCTGATTCCCAAGGACCTGAGAAGAGACATAAAACATCTCTGTTTAGCTTTTATACTTGCAGGGTTCATCGGGCCAATGTATGCCAAAGAGATTCTTCAAAAAGAAATGCTTTCTCATGTTGGTGTTGGGGAGTACTGTGA...

Protein

8 records

下载 Protein FASTA

XP_057801258.1
MRVKRRDAEQWMSRCLLPESLRQRIQIYKWQEIRGVDEDNLIPKDLRRDIKHLCLAFILAGFIGPMYAKEILQKEMLSHVGVGEYCETKSATLLPLHKAYPVIPAASAKAGNASADEALLCKSGTLNPRKAKGKFWCAYEGTT

XP_057801259.1
MRVKRRDAEQWMSRCLLPESLRQRIQIYKWQEIRGVDEDNLIPKDLRRDIKHLCLAFILAGFIGPMYAKEILQKEMLSHVGVGEYCETKSATLLPLHKAYPVIPAASAKAGNASADEALLCKSGTLNPRKAKGKFWCAYEGTT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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