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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002341`

染色体: Chr03 坐标: 36891599-36892932 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002341`
名称	SmilChr03G002341
描述	trihelix transcription factor GT-3b
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	36891599 - 36892932 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016549`
GeneID	`131016549`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016549`
原始查询	`SmilChr03G002341`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	trihelix transcription factor GT-3b
产物	trihelix transcription factor GT-3b
Arabidopsis	`AT2G38250` (AT2G38250) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818404] identity=45.8; qcov=1.11; evalue=5.87e-57; confidence=high
Rice	`Os05g0128000` - identity=37.2; qcov=1.12; evalue=1.91e-34; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13837 (Myb_DNA-bind_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016549

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801253.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801253.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801253.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801253.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057801253.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:36892047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr3:36892113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr3:36892114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:36892218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B40,C26
`Chr3:36892238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B55,B78,C27,C28
`Chr3:36892473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:36892520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C38,C71
`Chr3:36892659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr3:36892660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C18
`Chr3:36892720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801253.1

248 aa

124

248

Myb_DNA-bind_4

PF13837 Myb_DNA-bind_4 31-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801253.1`	Pfam	`PF13837`	Myb_DNA-bind_4	Domain	31	115	1.2e-21	77.6	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945270.1
ATAGGAATGAGAGAGAAAGAGAGATAGAGATAAGACTCACATATATATATAGAGAGAGAGAGAGATCCGTACAAGCAACGTGAAGGACGAACATCGCCAACTATTTTCCTTTGTCTAGCTAAGACGAAATTCAAATTTTCACACCATTTTCCATTTGGTTGATTTTTTAATCTTCAAAATCAAACTTTTTATATTTATGTATATGGATCATAGTCAATTTTCCCAAGTCCAGAATCCGTATGTTGGCGTGAGTGTCGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016549
ATGTATATGGATCATAGTCAATTTTCCCAAGTCCAGAATCCGTATGTTGGCGTGAGTGTCGAAACGGGTTTGGGCTGCGGGGATCGGAATCCTCAATGGAGCAGCGAAGAAACCCGGGATTTGCTGGCGATTCGGGGCCACCTCGACCCGACTTTCATGGAAACCAAGCGCAATAAGCTTCTCTGGGAACTGGTTTCGACCCGGATGAACCAAATCGGGTACAACCGGACCCCGATCCAGTGCAAATGCAAGTGGAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801253.1
MYMDHSQFSQVQNPYVGVSVETGLGCGDRNPQWSSEETRDLLAIRGHLDPTFMETKRNKLLWELVSTRMNQIGYNRTPIQCKCKWKNLVTRYKGCETMEEVEMRERAFPFYNEMQIIFNARMQRMMWQEVEGGAISPQMVSKAANSGCSSGNSSPVVDGLKEMMEEFMRQQMELEMQWIKAYEEREERRREREMEWRQRMEALESERLMMISWWREREEERKMREEARAERRDALLTALLDNLTRGAI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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