当前解析结果
SmilChr03G002348| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002348 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002348 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002348 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 37096507 - 37097205 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018739 |
|---|---|
| GeneID | 131018739 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018739 |
| 原始查询 | SmilChr03G002348 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018739 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057803429.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057803429.1 |
| 3 | Dendrite | Dendrite | 0.20000 | XP_057803429.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057803429.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803429.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:37096522 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr3:37096534 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 73 | A10,A15,A21,A23,A3,B1,B102,B103,B107,B109,B117,B14,B20,B3,B30,B32,B36,B48,B5,B53,B54,B55,B56,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B71,B84,B87,B88,B96,B97,C12,C17,C18,C23,C30,C35,C43,C44,C46,C5,C50,C51,C53,C55,C58,C6,C60,C62,C64,C66,C7,C71,C75,C76,C77,C79,C80,C81,C82,C84,C86,C87,D1,D11,D2,D6,D8,D9 |
Chr3:37096557 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,B76,B93 |
Chr3:37096574 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr3:37096575 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B65,B71,B82,B94 |
Chr3:37096596 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B98,B99 |
Chr3:37096602 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B130 |
Chr3:37096630 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 23 | A16,A18,B109,B111,B112,B115,B19,B2,B20,B21,B76,B78,B93,C23,C24,C30,C35,C39,C45,C53,C60,C66,D2 |
Chr3:37096632 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr3:37096645 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | C16,C25,C27 |
Chr3:37096645 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C16,C25,C27 |
Chr3:37096653 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B93 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。