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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002359`

染色体: Chr03 坐标: 37197532-37199867 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002359`
名称	SmilChr03G002359
描述	uncharacterized SmilChr03G002359
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	37197532 - 37199867 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016552`
GeneID	`131016552`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016552`
原始查询	`SmilChr03G002359`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820050]; symbol=AT3G08980; hit=AT3G08980; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820050]; symbol=AT3G08980; hit=AT3G08980; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G08980` (AT3G08980) Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820050] identity=60.1; qcov=0.935; evalue=3e-61; confidence=high
Rice	`Os04g0165600` (OsSigP3) - identity=47.2; qcov=0.953; evalue=2.3e-48; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006465 (GO:0006465); GO:0006627 (GO:0006627); GO:0016020 (membrane); GO:0033108 (mitochondrial respiratory chain complex assembly); GO:0042720 (mitochondrial inner membrane peptidase complex)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10502 (Peptidase_S26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016552

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057801257.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057801257.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057801257.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801257.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801257.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:37197651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr3:37197677`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B11,B117,D1
`Chr3:37197677`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B11,B117,D1
`Chr3:37197699`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A1,B129,B132,B2,B44,C12
`Chr3:37197728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B123,C13
`Chr3:37197755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B46,C37
`Chr3:37197767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B20,B54,B86
`Chr3:37197810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B130,B24,B92
`Chr3:37197949`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	A21,A23,A3,B1,B103,B107,B109,B117,B14,B30,B32,B36,B5,B54,B62,B64,B65,B71,B84,B87,B94,C12,C17,C23,C3,C30,C35,C43,C5,C50,C51,C55,C58,C6,C7,C71,C75,C76,C77,C79,C80,C82,C84,D1,D10,D8
`Chr3:37198993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C26,C37
`Chr3:37199010`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C72
`Chr3:37199010`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801257.1

169 aa

169

Peptidase_S26

PF10502 Peptidase_S26 10-100 aa PF10502 Peptidase_S26 100-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801257.1`	Pfam	`PF10502`	Peptidase_S26	Domain	10	100	9.6e-24	84.9	Signal peptidase, peptidase S26
`XP_057801257.1`	Pfam	`PF10502`	Peptidase_S26	Domain	100	148	9.6e-24	84.9	Signal peptidase, peptidase S26

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945274.1
CTCAAAAAGCTTGCCTTTGAACTATTGAAGTAAGTCCCAAAACCAAACATCTCATTCGCTCCGAGTCTCCTCCGCCCGGCCGTGGCGGCTACCGTCCATCGCCGAATTCAGAGATGTCTCCTCAAAATTTTCTGTTGGATGCAGCCAAAAAATATTTCACCGCAGGCATAGTCGGCCTCACCATTTCCGACCGATACGCTCGTTTTACAGCTGTTCGTGGTCCGTCCATGTCTCCGACTTTCAATCCCCATAGTAACAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016552
ATGTCTCCTCAAAATTTTCTGTTGGATGCAGCCAAAAAATATTTCACCGCAGGCATAGTCGGCCTCACCATTTCCGACCGATACGCTCGTTTTACAGCTGTTCGTGGTCCGTCCATGTCTCCGACTTTCAATCCCCATAGTAACAGCTCTACCGGATTTTCATTTGATGACTACGTATTGGTTGAGAAATTCTGCCTTGACAAGTTCTCCCGCGGCGACGTCGTCATTTTTCGTTCCCCAAGTGATTATAAGAAGAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801257.1
MSPQNFLLDAAKKYFTAGIVGLTISDRYARFTAVRGPSMSPTFNPHSNSSTGFSFDDYVLVEKFCLDKFSRGDVVIFRSPSDYKKKNIKRIVGLPGDWIDLPSLDETVRIPEGHCWVVGDNSACSLDSRSFGPIPLGLVCGRVTHIIWPPHRIGGVTNAFASSGERTSC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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