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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002361`

染色体: Chr03 坐标: 37238783-37243764 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002361`
名称	SmilChr03G002361
描述	uncharacterized SmilChr03G002361
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	37238783 - 37243764 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018740`
GeneID	`131018740`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018740`
原始查询	`SmilChr03G002361`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG00310` - identity=46.6; qcov=0.121; evalue=2.38e-21; confidence=weak
Rice	`Os06g0484800` - identity=29.3; qcov=0.367; evalue=4.53e-24; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018740

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803430.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803430.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803430.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803430.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803430.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:37241721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,D2
`Chr3:37241745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B118,B22,B24
`Chr3:37241747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:37241766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:37241780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B40,C26,C37
`Chr3:37241818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B99
`Chr3:37241834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B112,B77,B82,D11
`Chr3:37241848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B91
`Chr3:37241848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr3:37241919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B80
`Chr3:37241943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B55,B78,B9,C27
`Chr3:37241947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A18,B40,C26,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803430.1

725 aa

362

725

RVT_3

PF13456 RVT_3 591-709 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803430.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	591	709	3.2e-17	63.3	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947447.1
ATGAAGGAAACCCAAAAAGGGAAGCCCCAAATTTTATTTCCTCCTCTGCCTGAACCCGCCGCCGCCGCTGCTGAGGAACCGGCGAGTGGCCGTCGTTCTAAGCTTCATGTTCGGTTGAGGGCGCCGCCCCTCTCATCCGATTCACCTTCCTCAGTCTCGACGAAGCAACCCAACCGAGCCCTAGGTTCCTTCGGCTCAAGCGACATCGCCGCCACTGCCTGGGCTCGATCGCGCTTCAGAAATTCCGGCGGAGTCGACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018740
ATGAAGGAAACCCAAAAAGGGAAGCCCCAAATTTTATTTCCTCCTCTGCCTGAACCCGCCGCCGCCGCTGCTGAGGAACCGGCGAGTGGCCGTCGTTCTAAGCTTCATGTTCGGTTGAGGGCGCCGCCCCTCTCATCCGATTCACCTTCCTCAGTCTCGACGAAGCAACCCAACCGAGCCCTAGGTTCCTTCGGCTCAAGCGACATCGCCGCCACTGCCTGGGCTCGATCGCGCTTCAGAAATTCCGGCGGAGTCGACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803430.1
MKETQKGKPQILFPPLPEPAAAAAEEPASGRRSKLHVRLRAPPLSSDSPSSVSTKQPNRALGSFGSSDIAATAWARSRFRNSGGVDAALRLCLKTGVPPPTSQMRGRKEVSPNFLDQKSPPPPSPENQRARLKIQEGSLQLNCYRREFEALSGLLRQAVTRQLIHGARICRTAPHISHLLFADDCIIFGRANSTEIGEIRDILRQYESDSGQLVNLEKSSIFFSGGITVETKLLLARQMGVQCQGQLGTYLGIPSIVGRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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