当前解析结果
SmilChr03G002382| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002382 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002382 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002382 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 37603573 - 37604031 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018749 |
|---|---|
| GeneID | 131018749 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018749 |
| 原始查询 | SmilChr03G002382 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018749 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803437.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057803437.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803437.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803437.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803437.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:37603588 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B2,C8,C87 |
Chr3:37603612 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C13,C42 |
Chr3:37603642 |
T |
TAG |
2bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 2 | C28,C4 |
Chr3:37603642 |
T |
TAG |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | C28,C4 |
Chr3:37603659 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr3:37603691 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,B139,B71 |
Chr3:37603699 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 15 | A10,A7,B109,B11,B115,B131,B132,B14,B29,B34,B46,C26,C4,C42,C61 |
Chr3:37603749 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B135,B88,C63 |
Chr3:37603755 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,D9 |
Chr3:37603777 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B55,C77 |
Chr3:37603784 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B125,B88,C46,C63 |
Chr3:37603791 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B21,B64 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。