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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002392`

染色体: Chr03 坐标: 37867241-37868083 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002392`
名称	SmilChr03G002392
描述	uncharacterized SmilChr03G002392
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	37867241 - 37868083 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018755`
GeneID	`131018755`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018755`
原始查询	`SmilChr03G002392`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=28.6; qcov=0.975; evalue=7.34e-25; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=29.7; qcov=1.02; evalue=3.27e-28; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018755

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803443.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803443.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803443.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803443.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803443.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:37867269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr3:37867552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr3:37867559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr3:37867571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr3:37867651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B126,B22
`Chr3:37867690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr3:37867704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr3:37867705`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B105
`Chr3:37867705`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B105
`Chr3:37867742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B22
`Chr3:37867837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr3:37867838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803443.1

280 aa

140

280

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 42-136 aa PF00872 Transposase_mut 60-183 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803443.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	42	136	7.3e-16	59.0	MULE transposase domain
`XP_057803443.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	60	183	2.3e-06	27.5	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947460.1
ATGTTGAGACAATCCAATCCCGGTTCGTTGGTGGAGTGGAAAGTTGACCCTGATGGCCGATTCAAACACTTATTTGTTGCTCTTGCAGCTTCGGTTAGTTGTTTCATGTTCAACTTACGGCCAGTGATTGTAGTCGACGGCACACACTTGAAGGGCAAGAATAGGGGTATTCTGTTTGTTGCAGTGACCAAGGACGACAACGAGAGTTTATTCTCACTTGCATATGGTGTTGGCCCGAAAGAGAACGATGAATTGTGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018755
ATGTTGAGACAATCCAATCCCGGTTCGTTGGTGGAGTGGAAAGTTGACCCTGATGGCCGATTCAAACACTTATTTGTTGCTCTTGCAGCTTCGGTTAGTTGTTTCATGTTCAACTTACGGCCAGTGATTGTAGTCGACGGCACACACTTGAAGGGCAAGAATAGGGGTATTCTGTTTGTTGCAGTGACCAAGGACGACAACGAGAGTTTATTCTCACTTGCATATGGTGTTGGCCCGAAAGAGAACGATGAATTGTGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803443.1
MLRQSNPGSLVEWKVDPDGRFKHLFVALAASVSCFMFNLRPVIVVDGTHLKGKNRGILFVAVTKDDNESLFSLAYGVGPKENDELWMYFMSFIRRVYGQANPLLIVSDQHISIANAIRNELPNATHGLWYYHLQNNLKHYGKTVVELYRQAAFAYEKSDFTRAMNALKVMKRAAYDKLMRIGLEIWARSMCPIPVRRYIFMTSNAAEAFNARLLWARRLSICSMLETIRLVIKKWFSERLRAAQQSEESLSAEAGKMVAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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