当前解析结果
SmilChr03G002396| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002396 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002396 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002396 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 37977945 - 37979123 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018757 |
|---|---|
| GeneID | 131018757 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018757 |
| 原始查询 | SmilChr03G002396 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018757 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803444.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057803444.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057803444.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803444.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803444.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:37977989 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 18 | A10,A3,B1,B10,B18,B29,B31,B48,B83,B91,C11,C35,C46,C62,C65,C69,C76,C85 |
Chr3:37978023 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B97,C1 |
Chr3:37978032 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A9 |
Chr3:37978055 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 29 | B105,B109,B112,B12,B129,B15,B19,B31,B42,B43,B55,B78,B83,B9,B90,B92,C11,C18,C2,C27,C35,C48,C59,C63,C64,C66,C69,C79,C9 |
Chr3:37978061 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B114,B25,B68,B88,D2,D3,D9 |
Chr3:37978066 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B64,C39,C6 |
Chr3:37978067 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B140 |
Chr3:37978067 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr3:37978097 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B32,C64 |
Chr3:37978097 |
TTC |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | B32,C64 |
Chr3:37978104 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,D10 |
Chr3:37978120 |
G |
GAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 12 | A19,A25,A6,B100,B123,B36,B39,B96,C10,C44,C5,C9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。