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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002405`

染色体: Chr03 坐标: 38165020-38168150 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002405`
名称	SmilChr03G002405
描述	probable anion transporter 3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	38165020 - 38168150 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016593`
GeneID	`131016593`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016593`
原始查询	`SmilChr03G002405`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable anion transporter 3, chloroplastic
产物	probable anion transporter 3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G38060` (PHT4;2) phosphate transporter 4;2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818384] identity=72.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0451100` (OsPT23) probable anion transporter 2, chloroplastic [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4338960] identity=65.7; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005315 (phosphate transmembrane transporter activity); GO:0009536 (plastid); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00083 (Sugar_tr); PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016593

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057801286.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057801286.1`
3	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.20000	`XP_057801286.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057801286.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057801286.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:38165344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B13,B53,C73
`Chr3:38166019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:38166188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:38166283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:38166377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:38166431`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr3:38166431`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr3:38166827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr3:38166858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B105
`Chr3:38166858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr3:38166866`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B105
`Chr3:38166866`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B105

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801286.1

417 aa

208

417

MFS_1

Sugar_tr

PF07690 MFS_1 14-375 aa PF00083 Sugar_tr 40-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801286.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	14	375	4.9e-49	167.8	Major Facilitator Superfamily
`XP_057801286.1`	Pfam	`PF00083`	Sugar_tr	Family	40	178	7e-06	25.9	Sugar (and other) transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945303.1
TTTAAAAAATATAGTACATCCGGATATTATGAGGAGCGACCTCCATTTTCCACGATCTCTCTCTCTCTCTCATTCACAGCTCTGATGGCATGCGTTACGGCCTACGCTACCCCAATTACAGCTGAATTCATTCAATTTCACAAACAACTCATGCTACTACTCCTAGTCAACGGACATCAAATAATCTCACTCCATCTTCATAGCTTAGATTTCATTCCGAGAATGCGAGGAAGAGGGGAATAGAGCTGAGCGATGGCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016593
ATGGCGGCGGAGAGGTTCAAGGTGGTGGCGCTGGTGGCTGCTGTGATGTGTTTGTGCAGTGCAGATAGAGTCGTCATGTCGGTCGTCGTCGTCCCCCTTGCCGCCAAAAATGGCTGGACCACTTCCTTCTTGGGCATTGTCCAGTCATCGTTTCTATGGGGATATATGTGTTCCTCAGTTATAGGAGGAGCCTTGGTGGATAAACATGGAGGAAGAAAAGTTCTAGCAATCGGTGCAGCTTTGTGGTCTCTCGCTACTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801286.1
MAAERFKVVALVAAVMCLCSADRVVMSVVVVPLAAKNGWTTSFLGIVQSSFLWGYMCSSVIGGALVDKHGGRKVLAIGAALWSLATLLTPWAAIHSTTGLLAVRVFFGLAEGVALPSMNNLLSRWFPTNERATAVGISMGGFQLGNVLGLVITPLAISSVGISGPFILFTFLGFLWLITWAYRVPNDPQESTCISKLELKLIQAGKSDPCLAKGKLPPLSLLFSKLPTWAIIFANITNNWGYFVLLSWMPVYFNTVFGVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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