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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002408`

染色体: Chr03 坐标: 38271821-38274358 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002408`
名称	SmilChr03G002408
描述	ataxin-3 homolog
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	38271821 - 38274358 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016595`
GeneID	`131016595`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016595`
原始查询	`SmilChr03G002408`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ataxin-3 homolog
产物	ataxin-3 homolog
Arabidopsis	`AT3G54130` (AT3G54130) Josephin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824580] identity=67.5; qcov=0.93; evalue=1.45e-120; confidence=high
Rice	`Os01g0851400` - identity=65.5; qcov=0.887; evalue=8.47e-118; confidence=high
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02099 (Josephin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016595

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801288.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801288.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057801288.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057801288.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:38272014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:38272151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B13,B53,C73
`Chr3:38272223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,D10
`Chr3:38273850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801288.1

301 aa

150

301

Josephin

PF02099 Josephin 25-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801288.1`	Pfam	`PF02099`	Josephin	Family	25	177	1.5e-53	181.5	Josephin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945305.1
GGTTTAATATAAATTTTTAAACTTGCAAATGAAATATTGATCAATTTTTCTTGGAAAAAGATATTGATTATGTTTGTCTCCTTGTTAATCACAATTCACAAACAAAAAGGCAACTGAACTCCATCGCTGCAATTTATCTAGGTTAGAAACGGTGATTGGGGTTTAGAGAGAGAGAGAGAGAATGAGTAGTAACGCAGAAGGGGGAGGGGGAGGGGGAGGGGCCAGCAACGGGGGGATGTTGTACCACGAGGTACAAGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016595
ATGAGTAGTAACGCAGAAGGGGGAGGGGGAGGGGGAGGGGCCAGCAACGGGGGGATGTTGTACCACGAGGTACAAGAGTCGAAGCTGTGCGCGGTGCATTGCGTGAACACAGTGTTGCAGGGCCCCTTTTTCTCGGAGTTCGATTTGGCGGCGTTGGCCTCCGATCTAGATCGTACGGAGCGGCAAATGATGCTCGGCGCCGTCACCGGAGATTTTCTCCCCGAACTCTCGCATAATGTCTCTCTCGATGGCGACTTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801288.1
MSSNAEGGGGGGGASNGGMLYHEVQESKLCAVHCVNTVLQGPFFSEFDLAALASDLDRTERQMMLGAVTGDFLPELSHNVSLDGDFSIQVLQKALEVWDLQVIPLDSPVAEPAQIDPEKENAFICHLQDHWFCIRKVNGEWYNFDSLYPAPEHLSKFYLSAYLDSLKGFGWSIFLVRGNFPKECLVTSSEASNGFGQWLLPEDAERITKSCNTASRTQKVTGQQQQQQQQQQQQLSDPYMQYDDAQMLLDDEDEDLKAAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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