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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002409`

染色体: Chr03 坐标: 38278834-38280876 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002409`
名称	SmilChr03G002409
描述	uncharacterized SmilChr03G002409
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	38278834 - 38280876 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018767`
GeneID	`131018767`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018767`
原始查询	`SmilChr03G002409`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=38.9; qcov=0.11; evalue=2.44e-09; confidence=weak
Rice	`Os12g0292200` - identity=44.3; qcov=0.134; evalue=8.1e-17; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018767

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803454.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803454.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057803454.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803454.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803454.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:38278879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B48
`Chr3:38278903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,D9
`Chr3:38278920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr3:38278921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr3:38278950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C86,D2
`Chr3:38278953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C79,C9
`Chr3:38278973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B131,B23,C62
`Chr3:38278980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B58,B87,C37,C74
`Chr3:38278981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C63
`Chr3:38278993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B8,C16,C29,C86
`Chr3:38279001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B97,C45,D2
`Chr3:38279008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B8,C29,C45,C5

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947471.1
ATGGCTACTGCGGAAGAAGTCCGTGCTTTGAGAGAGCAGTTGCAGGCGTTGATGGATGCTCAGAAAAATGTTGATGAGCAGAAACAGCCGCCTATTGATGAGGCATTTACTCCACTGTACCAGTACCAAGAGCCGCCCAGAGTCAACGCAAATAATTTCGAGCTAAGGACTGGGCTGATTACCATGGTACAACAGAACCAATATGGAGGTAGTGCCATAGAGGATCCGAATGTGCATTTGAGACAGTTTCTGGAGTTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018767
ATGGCTACTGCGGAAGAAGTCCGTGCTTTGAGAGAGCAGTTGCAGGCGTTGATGGATGCTCAGAAAAATGTTGATGAGCAGAAACAGCCGCCTATTGATGAGGCATTTACTCCACTGTACCAGTACCAAGAGCCGCCCAGAGTCAACGCAAATAATTTCGAGCTAAGGACTGGGCTGATTACCATGGTACAACAGAACCAATATGGAGGTAGTGCCATAGAGGATCCGAATGTGCATTTGAGACAGTTTCTGGAGTTATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803454.1
MATAEEVRALREQLQALMDAQKNVDEQKQPPIDEAFTPLYQYQEPPRVNANNFELRTGLITMVQQNQYGGSAIEDPNVHLRQFLELCSTIKMNGVADDIIRLRLFPFSLRDKAKSWYHTLQLGANPAWEELAHLFLQKFHPPGLTLKLKMDIIQFQQFEGESLAETWERYQEKLRKCPSHGFDEGTLVVMFYNACGERTRMFMDTAAGGSLLKKGSVEAMEIIESMAATSYQWPSERVQLKKVAVASSSDPLAMISTQLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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