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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002424`

染色体: Chr03 坐标: 38506408-38510129 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002424`
名称	SmilChr03G002424
描述	serine/threonine-protein kinase BSK5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	38506408 - 38510129 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016610`
GeneID	`131016610`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016610`
原始查询	`SmilChr03G002424`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase BSK5-like
产物	serine/threonine-protein kinase BSK5-like
Arabidopsis	`AT5G59010` (BSK5) kinase with tetratricopeptide repeat domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836018] identity=77.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0825300` (OsRLCK119) - identity=63.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0009742 (brassinosteroid mediated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF25575 (TPR_BSK1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016610

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801299.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801299.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801299.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801299.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801299.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:38506719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B106,B132,B82
`Chr3:38506728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B58,C31
`Chr3:38507065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B95,B98
`Chr3:38507376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B115,B23
`Chr3:38507586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B25,B88,D3
`Chr3:38509794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801299.1

489 aa

244

489

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

TPR_BSK1_C

PF00069 Pkinase 69-304 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 69-307 aa PF25575 TPR_BSK1_C 343-459 aa

XP_057801300.1

488 aa

244

488

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

TPR_BSK1_C

PF00069 Pkinase 69-304 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 69-307 aa PF25575 TPR_BSK1_C 342-458 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801299.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	69	304	2e-22	80.6	Protein kinase domain
`XP_057801299.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	69	307	8.9e-27	94.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057801299.1`	Pfam	`PF25575`	TPR_BSK1_C	Repeat	343	459	1.3e-63	212.9	Serine/threonine-protein kinase BSK1-like, TPR repeats
`XP_057801300.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	69	304	2e-22	80.6	Protein kinase domain
`XP_057801300.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	69	307	8.9e-27	94.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057801300.1`	Pfam	`PF25575`	TPR_BSK1_C	Repeat	342	458	1.3e-63	212.9	Serine/threonine-protein kinase BSK1-like, TPR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945316.1
AAGACAGCATAAAGCAGGAAAAGCTAAAACCAGGGGTGCCAAAATATTTAAAAAGAAACACCTTTTCGTGAACCCACACACAATACAACTGTTCACCAAAATCGACCCCAAAAAATCATAGCTTGTCTCTAATTCACACTCCCACCATGCTTATAATGCATGCTTCTCAAATGTGAATGCCGAAACCCGCGTTGCAATCACGTTTCTTGGATCCGTAAGCCCCCCAAAATCTGGTCTTTTGCAGATATTAGTACTCATAT...

XM_057945317.1
AAAGCAGGAAAAGCTAAAACCAGGGGTGCCAAAATATTTAAAAAGAAACACCTTTTCGTGAACCCACACACAATACAACTGTTCACCAAAATCGACCCCAAAAAATCATAGCTTGTCTCTAATTCACACTCCCACCATGCTTATAATGCATGCTTCTCAAATGTGAATGCCGAAACCCGCGTTGCAATCACGTTTCTTGGATCCGTAAGCCCCCCAAAATCTGGTCTTTTGCAGATATTAGTACTCATATTTTTCCACAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016610
ATGGGTGGACGCTGCTCCAAGTTCTCTCTGTGTTGGTGGCATTCCCAGCTCAAGCCCACCACGCTTCAATCATCTGATCCGGAGAATGGGGAGAAAGATTCGCTGCCGAGCTTCAGGGAGTTCAAATGGGACGAGCTGAAGGCTGCGACGAATGGGTTTTCTTCAGAAAACATTGTTTCAGAGCATGGAGAGAAGGCTCCTAACGTTGTTTACAAAGGTTTACTTGAAAATGAGCGGTGGGTTGCTGTTAAGCGCTTCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801299.1
MGGRCSKFSLCWWHSQLKPTTLQSSDPENGEKDSLPSFREFKWDELKAATNGFSSENIVSEHGEKAPNVVYKGLLENERWVAVKRFNRSAWPDSRQFLDEAKAVGSLRSERLANLVGCCIEGEERLLVAEFMPNETLAKHLFHWEDQPMKWAMRLRVTLYLAQALEYCSNKGRALYHDLNAYRVLFDQDGNPRLSCFGLMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYLRTGRVTPESVVYSFGTMLLDLLSGKHIPPSHALDLIRGK...

XP_057801300.1
MGGRCSKFSLCWWHSQLKPTTLQSSDPENGEKDSLPSFREFKWDELKAATNGFSSENIVSEHGEKAPNVVYKGLLENERWVAVKRFNRSAWPDSRQFLDEAKAVGSLRSERLANLVGCCIEGEERLLVAEFMPNETLAKHLFHWEDQPMKWAMRLRVTLYLAQALEYCSNKGRALYHDLNAYRVLFDQDGNPRLSCFGLMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYLRTGRVTPESVVYSFGTMLLDLLSGKHIPPSHALDLIRGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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