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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002436`

染色体: Chr03 坐标: 38684669-38685895 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002436`
名称	SmilChr03G002436
描述	uncharacterized SmilChr03G002436
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	38684669 - 38685895 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018772`
GeneID	`131018772`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018772`
原始查询	`SmilChr03G002436`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018772

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803460.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057803460.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057803460.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057803460.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803460.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:38684682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B67,B86,B97,C46,C58
`Chr3:38684697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B91
`Chr3:38684709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B131,C39
`Chr3:38684771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B62,B86,C51,C7
`Chr3:38684775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B5,C58
`Chr3:38684777`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A25,A4,A7,B16,B36,B84,B91,B95,B99,C22,C34,C39,C49,C78,C86,D6,D7
`Chr3:38684778`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	A10,A14,A15,A18,A22,A8,B111,B12,B120,B129,B133,B20,B24,B28,B30,B42,B43,B48,B52,B53,B55,B56,B62,B66,B71,B72,B87,B9,B90,B92,B96,B97,C27,C32,C38,C44,C51,C61,C63,C64,C66,C68,C80,D11,D2,D5
`Chr3:38684780`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B42,B66,C14
`Chr3:38684780`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B42,B66,C14
`Chr3:38684782`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C37
`Chr3:38684782`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C37
`Chr3:38684812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C51,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803460.1

408 aa

204

408

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 139-204 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803460.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	139	204	3.9e-10	40.7	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947477.1
ATGGAGAATACCAGGCTGAAAAACCAAGTGTCGCAACTAAAACACCAGCTCAAGGATCTGGAAGATTCACTGAGGGAGAAATCCCAGAGGGACGACAGAGGGCAAAGGTCAGAGAAATCAAACAGAGCAGAGAAGTCGTATCGGTCAGAGAGATCCCGCCGTTCAGAGAAATCACATTATACAGAGAAGTCAGAGGGACGGGAGCTGGAGTATTCCTCTGGCAGGCCAGGGCACAAGGGTCACAAGCGCCACCACGCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018772
ATGGAGAATACCAGGCTGAAAAACCAAGTGTCGCAACTAAAACACCAGCTCAAGGATCTGGAAGATTCACTGAGGGAGAAATCCCAGAGGGACGACAGAGGGCAAAGGTCAGAGAAATCAAACAGAGCAGAGAAGTCGTATCGGTCAGAGAGATCCCGCCGTTCAGAGAAATCACATTATACAGAGAAGTCAGAGGGACGGGAGCTGGAGTATTCCTCTGGCAGGCCAGGGCACAAGGGTCACAAGCGCCACCACGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803460.1
MENTRLKNQVSQLKHQLKDLEDSLREKSQRDDRGQRSEKSNRAEKSYRSERSRRSEKSHYTEKSEGRELEYSSGRPGHKGHKRHHAHDSPKERREHGRYKENKRAKTSRFHPINNRSPFSDDILADTLPRSYKPISLDYDGTIDPEVHLNRFEGLVTLHMYTEGIKCRIFSTTLTGPAQLWFGMFAPNSIRSFEELQVRFLRQFASSRRVGKSALSLMDIKQDQNETLREYTTRFNLAALEVPEAESQIKNCAYVRGLKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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