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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002453`

染色体: Chr03 坐标: 38894974-38901084 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002453`
名称	SmilChr03G002453
描述	probable glutathione S-transferase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	38894974 - 38901084 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016621`
GeneID	`131016621`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016621`
原始查询	`SmilChr03G002453`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glutathione S-transferase
产物	probable glutathione S-transferase
Arabidopsis	`AT3G09270` (GSTU8) glutathione S-transferase TAU 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820083] identity=51.2; qcov=0.986; evalue=9.36e-72; confidence=high
Rice	`Os01g0949800` (OsGSTU36) - identity=50; qcov=0.972; evalue=1.47e-67; confidence=high
GO	GO:0004364 (glutathione transferase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006749 (glutathione metabolic process)
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00043 (GST_C); PF02798 (GST_N); PF13409 (GST_N_2); PF13417 (GST_N_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016621

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057801312.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057801312.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801312.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801312.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801312.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:38895211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C37
`Chr3:38895237`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A10,B114,B122,B124,B125,B127,B17,B21,B49,C28,C58,C62,C73,C74,D11
`Chr3:38895280`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A6
`Chr3:38895280`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A6
`Chr3:38895466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B127
`Chr3:38900715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,C22,C46,C56
`Chr3:38900744`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B94
`Chr3:38900744`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B94
`Chr3:38900919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801312.1

214 aa

107

214

GST_N

GST_N_3

GST_N_2

GST_C

PF02798 GST_N 3-73 aa PF13417 GST_N_3 10-74 aa PF13409 GST_N_2 11-73 aa PF00043 GST_C 97-189 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801312.1`	Pfam	`PF02798`	GST_N	Domain	3	73	5.5e-17	62.6	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057801312.1`	Pfam	`PF13417`	GST_N_3	Domain	10	74	8e-15	55.6	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057801312.1`	Pfam	`PF13409`	GST_N_2	Domain	11	73	1e-15	58.8	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057801312.1`	Pfam	`PF00043`	GST_C	Domain	97	189	1.4e-12	48.4	Glutathione S-transferase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945329.1
TTAATTTGCAAGGATCCGATTCAATATATTTTTTTATGTCCAATCTATCTTATAGAACAAGTTAATAAGCCAATATATAGCTCATCAACCAAAACCAAAATCACTATCTTCCAAATATTTCATATAAAAAAAATACAACCAAATATGGCAGAAGTGAAGGTGATTGGAAATTTGTATAGCCCATTTGTGAGGAGAGTAGAAGTGGCTCTCAAAATGAAAGGTGTGGAATATGATTATATTGAAGATCTGAGAAACAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016621
ATGGCAGAAGTGAAGGTGATTGGAAATTTGTATAGCCCATTTGTGAGGAGAGTAGAAGTGGCTCTCAAAATGAAAGGTGTGGAATATGATTATATTGAAGATCTGAGAAACAAATCAGCTCTCCTTCTACAACACAATCCAATTCATAAAGTGCCAGTTTTGGTACACAATGGCAAAGCAATTGTTGAATCGATGGTAATTCTTGAATACATCGATGAGGTGTGGGAGGGTCCAACCATTCTTCCCAAAGATCCTTATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801312.1
MAEVKVIGNLYSPFVRRVEVALKMKGVEYDYIEDLRNKSALLLQHNPIHKVPVLVHNGKAIVESMVILEYIDEVWEGPTILPKDPYDRAMARFWVNFIDDKCTPAMWKACWSRGEEQEKLKEEAREALKYLENEIKGKKYFGGDKMGIVDHAANFIGYWFPITSDFVGLQLMTDNEFPHLCRWADDYCNHIFVKENVPDKDSYVARLKTIQINC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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