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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002458`

染色体: Chr03 坐标: 38923962-38926523 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002458`
名称	SmilChr03G002458
描述	uncharacterized SmilChr03G002458
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	38923962 - 38926523 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016626`
GeneID	`131016626`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016626`
原始查询	`SmilChr03G002458`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RLIM-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831782]; symbol=SIS; hit=AT5G02020; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	E3 ubiquitin-protein ligase RLIM-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831782]; symbol=SIS; hit=AT5G02020; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G02020` (SIS) E3 ubiquitin-protein ligase RLIM-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831782] identity=49.2; qcov=1.03; evalue=9.12e-30; confidence=medium
Rice	`Os05g0454500` - identity=37.9; qcov=0.532; evalue=1.12e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016626

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801318.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801318.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057801318.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801318.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801318.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:38924144`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A22,A4,A8,B1,B101,B105,B115,B135,B19,B40,B7,B78,B8,C16,C20,C3,C34,C54,C72,D5,D7
`Chr3:38924157`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	58	A1,A20,A24,A25,A6,B100,B102,B103,B104,B108,B110,B117,B119,B128,B14,B140,B18,B27,B33,B35,B41,B45,B51,B61,B64,B65,B71,B74,B78,B8,B81,B85,B89,B9,B97,C10,C13,C17,C21,C23,C24,C27,C29,C31,C45,C49,C55,C57,C58,C60,C7,C70,C74,C82,C85,C87,D1,D11
`Chr3:38925725`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A22,C34,C63,C67
`Chr3:38925725`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A22,C34,C63,C67
`Chr3:38925962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B95,B98
`Chr3:38925964`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A13,B13,B27,B34,B61,B86,C13,C36,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945337.1
CAGTTTGAGCAAACGACGTCTGTTAACCGAAAGTGAAAACACCAAAACCAACCAGATATGTCCATTTTATTTTCTCTCTTTCCACACCAAAAAAAAAAATGTTGACCGAGACAATATATATATATATACACATGCAACTCTCTCTTACCCCGTGCGTCTGAATATACAAGAATCACACATATCTGGTGTTTTTAAATAACATCATTTAATCCTAGACGTTGGTTTGATGTTTGGAAGATTCTGGGCGGTTAGGTTTGTTT...

XM_057945336.1
TGTCCATTTTATTTTCTCTCTTTCCACACCAAAAAAAAAAATGTTGACCGAGACAATATATATATATATACACATGCAACTCTCTCTTACCCCGTGCGTCTGAATATACAAGAATCACACATATCTGGTGTTTTTAAATAACATCATTTAATCCTAGACGTTGGTTTGATGTTTGGAAGATTCTGGGCGGTTAGGTTTGTTTGTTGACGGTGGGCAATCGCCTTCTCTTTAAGCCAAGAGCAACAAGAGAGATGGAAACA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131016626
ATGGAAACAGGGAAGCAATCGTCTTCTTCATTCACTTCTGATCTTTTTGGGGCCAAGGATTCTTCTTCATCTTCTCAGATTTTGAGCTCCATTTTTGCCCCACCTGCTAAGGTGAGTGGACTGGAAAATGAGAAGAAGAATGGTTCTGTAACTCAAGCGTCTACTGCAAAAACAGGTGAGAAGGAGAAAAGATCGTATTTGGAGGAGGAGAAAACGACGCCGTTTCACTACAGCTCGTCGATATACTACGGTGGGCAAGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057801318.1
METGKQSSSSFTSDLFGAKDSSSSSQILSSIFAPPAKVSGLENEKKNGSVTQASTAKTGEKEKRSYLEEEKTTPFHYSSSIYYGGQDVYSQPHSSSLTTLNKDVGEDESDSASRGNWWQGAFSHAPFIHQSVFSIFN

XP_057801319.1
METGKQSSSSFTSDLFGAKDSSSSSQILSSIFAPPAKVSGLENEKKNGSVTQASTAKTGEKEKRSYLEEEKTTPFHYSSSIYYGGQDVYSQPHSSSLTTEMQLNKDVGEDESDSASRGNWWQGSLYY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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