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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002464`

染色体: Chr03 坐标: 39084385-39090529 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002464`
名称	SmilChr03G002464
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.6-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39084385 - 39090529 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016617`
GeneID	`131016617`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016617`
原始查询	`SmilChr03G002464`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.6-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.6-like
Arabidopsis	`AT3G53960` (AT3G53960) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824563] identity=59.3; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0823500` (OSJNBb0081B07.12) - identity=57.3; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0042937 (tripeptide transmembrane transporter activity); GO:0042938 (dipeptide transport); GO:0055085 (transmembrane transport); GO:0071916 (dipeptide transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016617

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801305.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801305.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801305.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801305.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801305.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39084501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C23,C55
`Chr3:39084555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C23,C45
`Chr3:39088250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B99,D10
`Chr3:39088508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr3:39088509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:39088511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:39088519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92
`Chr3:39088523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,C23,C55,D8
`Chr3:39088536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C54,C65
`Chr3:39088541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B119,B71
`Chr3:39088548`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B111,B72,C51
`Chr3:39088548`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B111,B72,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801305.1

588 aa

294

588

PTR2

PF00854 PTR2 111-528 aa

XP_057801306.1

520 aa

260

520

PTR2

PF00854 PTR2 43-460 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801305.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	111	528	5.5e-91	306.1	POT family
`XP_057801306.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	43	460	4.3e-92	309.7	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945322.1
TCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATGTATATAAGAGTGACCAGCCAAAGTTGCTAACCCACACAACTTAAGTAGCTAAGTAAATTGAAGCAAGAAAATGGATCAAAACATGAAAACAAATGAAGGTGCAGCTGCGGCAGAGCATATTGATGAGGAGAAATGGGTGTATGACTCTTCTGTTGATTATAAAGGAAGAATTCCTCTTCGAGCTTCTACTGGTGCATGGAAGGCTTCCCTCTTCATTATAGCAACGGA...

XM_057945323.1
ATGAAAACAAATGAAGGTGCAGCTGCGGCAGAGCATATTGATGAGGAGAAATGGGTGTATGACTCTTCTGTTGATTATAAAGGAAGAATTCCTCTTCGAGCTTCTACTGGTGCATGGAAGGCTTCCCTCTTCATTATAGAATTCAAACCCAAGATCTGCATTCATCCAACAAGATGATGCATCCACCGTAGATCTTAATGATCGAATGGCTGCAAATGGTTCTCCGTTCTTCTTTTATTTAGTGGTTCTTTCTTGAATCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016617
ATGGATCAAAACATGAAAACAAATGAAGGTGCAGCTGCGGCAGAGCATATTGATGAGGAGAAATGGGTGTATGACTCTTCTGTTGATTATAAAGGAAGAATTCCTCTTCGAGCTTCTACTGGTGCATGGAAGGCTTCCCTCTTCATTATAGCAACGGAGTTTAGCGAGCGATTGAGTTATTTTGGGCTAGCTGTAAACTTGATCATGTACCTCACCACCGTACTTCACCAAGACCTCAAAACAGCAGCTAAGAGTTGTAA...

LOC131016617
ATGTACCTCACCACCGTACTTCACCAAGACCTCAAAACAGCAGCTAAGAGTTGTAACTATTGGTCTGGTGTCACCACAATCATGCCCTTACTCGGAGGCTTCCTAGCCGATGCTTACCTCGGCCGCTTCTCCACCGTCATGCTTTCCTCCCTTATCTATATAATGGGCTTACTTCTCTTGACAATGTCAAGAGTGGTCCCGGGGCTAAGGCCCTTGGACGCGGGGTCCGCTGGCGGATCCCATAGGGTCCACGAGGTTGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801305.1
MDQNMKTNEGAAAAEHIDEEKWVYDSSVDYKGRIPLRASTGAWKASLFIIATEFSERLSYFGLAVNLIMYLTTVLHQDLKTAAKSCNYWSGVTTIMPLLGGFLADAYLGRFSTVMLSSLIYIMGLLLLTMSRVVPGLRPLDAGSAGGSHRVHEVVFFLAMYLISVGTGGHKPSLESFGADQFDDDHPIEKRKKMSFFNWWCFGLCCGLLLGVTVIVYIQDHVGWAVADIILTTVMVSTTAIIWIGRPLYRYRKPMGSPLT...

XP_057801306.1
MYLTTVLHQDLKTAAKSCNYWSGVTTIMPLLGGFLADAYLGRFSTVMLSSLIYIMGLLLLTMSRVVPGLRPLDAGSAGGSHRVHEVVFFLAMYLISVGTGGHKPSLESFGADQFDDDHPIEKRKKMSFFNWWCFGLCCGLLLGVTVIVYIQDHVGWAVADIILTTVMVSTTAIIWIGRPLYRYRKPMGSPLTPMMQVIVAAFVKRRLPYPVDSDQLYEIPKSDKNQGGRLLLHTNKLRFLDKAAIVEDEVVSKEKANPWR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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