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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002466`

染色体: Chr03 坐标: 39132943-39139652 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002466`
名称	SmilChr03G002466
描述	serine/threonine-protein kinase ATG1c-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39132943 - 39139652 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016616`
GeneID	`131016616`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016616`
原始查询	`SmilChr03G002466`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase ATG1c-like
产物	serine/threonine-protein kinase ATG1c-like
Arabidopsis	`AT2G37840` (AT2G37840) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818361] identity=58.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0268200` (OsATG1a) - identity=48.9; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006914 (autophagy); GO:0018105 (peptidyl-serine phosphorylation)
KEGG	smil04136 (Autophagy - other - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF24497 (MIT_ATG1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016616

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801304.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057801304.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801304.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801304.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801304.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39133255`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr3:39133255`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr3:39133258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:39133265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,D1
`Chr3:39133290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr3:39133475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:39134082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr3:39134182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B68,B75,C33,C4
`Chr3:39134219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B47,C33,C72,D4
`Chr3:39134229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C27,C42
`Chr3:39134331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B68,B75,C33,C4
`Chr3:39134334`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801304.1

719 aa

360

719

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

MIT_ATG1

PF00069 Pkinase 14-272 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 16-266 aa PF24497 MIT_ATG1 487-613 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801304.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	14	272	4.9e-74	249.8	Protein kinase domain
`XP_057801304.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	16	266	2.1e-48	165.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057801304.1`	Pfam	`PF24497`	MIT_ATG1	Domain	487	613	6e-47	159.7	ATG1, MIT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945321.1
GTGTATTGTGTGTGTGAAGATCAAATAAAATATAGACATGAATCCCAATCATAAAAATATGATATCGTACATTAGAAAGGCATGTCACACCCAAACACCAACACCCTCATTATCACCAAACATTATTCAATCAACCAATCCAATTCAAAAACCTCCATAAATATTCCCAAATTTCCGCCATTTTTCGATGATCAATTCATCATCCCTAAAAAAAGTGAATAAAAACAAAGGAAAAAGAAAACCCCAAAACCCCCCAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016616
ATGGCACAGCCGATGAGGAGGTACTACGCCGTCGGCGATTATGTGGTGGGGAAGCAGATTGGGGCAGGCTCCTTCTCGACTGTGTGGCACGCGCGCCACCGCGTCCACGGCACGGAGGTGGCGATCAAGGAGATCGCCACCGCCCGGTTAAATTCGAAGCTGCAGGAGAGTCTCAAGTCGGAGATTTTCATCCTGAAGAGGATCAATCACCCGCATATTATCCGATTGCACGATATGATCGAGGAACCTGGGAAGATCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801304.1
MAQPMRRYYAVGDYVVGKQIGAGSFSTVWHARHRVHGTEVAIKEIATARLNSKLQESLKSEIFILKRINHPHIIRLHDMIEEPGKIYIVLEYCKGGDLSMYIQQRQGKVSEATAKHFMQQLAEGLKVLRENNLIHRDLKPQNLLLSTNADNSILKIADFGFARSLQPRGLAETLCGSPLYMAPEIMQLQKYDAKADLWSVGAILFQLVTGKTPFTGCNQIQLLQNIIKSNDLQFPPEAKNLNPHCIDLCTKLLRRNPVER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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