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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002476`

染色体: Chr03 坐标: 39215602-39221150 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002476`
名称	SmilChr03G002476
描述	uncharacterized SmilChr03G002476
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39215602 - 39221150 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016649`
GeneID	`131016649`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016649`
原始查询	`SmilChr03G002476`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycosyltransferase (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818350]; symbol=AT2G37730; hit=AT2G37730; species=arabidopsis; confidence=high
产物	glycosyltransferase (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818350]; symbol=AT2G37730; hit=AT2G37730; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G37730` (AT2G37730) glycosyltransferase (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818350] identity=56.2; qcov=0.833; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0269900` - identity=49.7; qcov=0.86; evalue=3.08e-140; confidence=high
GO	GO:0008375 (acetylglucosaminyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02434 (Fringe); PF04646 (DUF604)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016649

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057801329.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057801329.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801329.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801329.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801329.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39216137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr3:39216160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr3:39216191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B28,D3
`Chr3:39216213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B47,C33,C72,D4
`Chr3:39216236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:39216298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr3:39216558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B68,C33,C4
`Chr3:39216717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:39216727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:39216795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr3:39216807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B107,B54
`Chr3:39217554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B106,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801329.1

515 aa

258

515

Fringe

DUF604

PF02434 Fringe 168-297 aa PF04646 DUF604 233-486 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801329.1`	Pfam	`PF02434`	Fringe	Domain	168	297	1.1e-12	48.5	Fringe-like
`XP_057801329.1`	Pfam	`PF04646`	DUF604	Family	233	486	3.9e-102	341.7	Protein of unknown function, DUF604

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945346.1
CTAGCATGCATGCCACAATTAATTAATTAATTGTTATTGATTGCGTTGGTATTCGTAGTTGAGTGCACATCTCAAATATTTTAGAGAATATTTCCACACGTACACCAAACAATCCATAATGCCAAAGTTGTGCTCCACTCCTAATCAATGAACTTTGCATGCAACCAAAAACTGCAAAAATTCAAAGAATCACATCGTTATTAATTACACATTAATCATCTGCAAAAAAAAACCTAGATTTTTTCCCAATCCCATTTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016649
ATGAAAATCAAAATGCCAAATTCATCATCACCGGAGACCACAATCCACGACCCTTTAAAACCCTGGAAACACCTCCTCTCCCCGCCGCTGAAAATCCCCATTTTAACCTCCAATACCATGAAAGCCCTCCTCGCAATCTGCATCTTGGGGGCATTTCCGATATTCTACCTCTCGTCGTCGCCGGCCACCGCGAGATGGCGGGCCACCGACTGCCCGGAATGCGATCGGACCATCCGCGGTCAGCTCCGCCGGATCACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801329.1
MKIKMPNSSSPETTIHDPLKPWKHLLSPPLKIPILTSNTMKALLAICILGAFPIFYLSSSPATARWRATDCPECDRTIRGQLRRITDNGLARAGTNISHIVFGIGGSAETWSTRRRYCELWWKPNATRGHVWLDRRPAKAWPATSPPYRVSGDTARFKYTNWYGKRSAVRIARIVKESFEAAAAAAEGEGEVRWFVMGDDDTVFFTENLVDLLNRYDDREMYYIGGSSESVEQNVVHSYTMAYGGGGFAVSYPLAAELVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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