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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002480`

染色体: Chr03 坐标: 39360329-39362283 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002480`
名称	SmilChr03G002480
描述	protein FAR-RED-ELONGATED HYPOCOTYL 1-LIKE-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39360329 - 39362283 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016652`
GeneID	`131016652`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016652`
原始查询	`SmilChr03G002480`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR-RED-ELONGATED HYPOCOTYL 1-LIKE-like
产物	protein FAR-RED-ELONGATED HYPOCOTYL 1-LIKE-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0009639 (response to red or far red light)
KEGG	-
Pfam	PF30962 (FHY1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016652

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801332.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057801332.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057801334.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057801332.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801333.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39360639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:39361486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B94,C32,C68
`Chr3:39361712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,C56,C58,C85,D10
`Chr3:39361777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B68,B97
`Chr3:39361829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr3:39361853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,C33,C4
`Chr3:39361902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B94,C32,C68
`Chr3:39361980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B68,C48,C8,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801332.1

216 aa

108

216

FHY1

PF30962 FHY1 8-184 aa

XP_057801333.1

209 aa

104

209

FHY1

PF30962 FHY1 8-209 aa

XP_057801334.1

191 aa

191

FHY1

PF30962 FHY1 6-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801332.1`	Pfam	`PF30962`	FHY1	Family	8	184	6.8e-18	66.5	Far-red elongated hypocotyl 1
`XP_057801333.1`	Pfam	`PF30962`	FHY1	Family	8	209	6.6e-33	115.6	Far-red elongated hypocotyl 1
`XP_057801334.1`	Pfam	`PF30962`	FHY1	Family	6	159	4.6e-14	54.0	Far-red elongated hypocotyl 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945350.1
GGGCTGATTAGAAATGAGGTGGACCGGCCTGGTTGGGATCCCTAGTTTTGCTTGACCGACCTTTGCTTAAATAAAAAGGTTAGTCCACGTTTCGAACATCCAAGGGTGAAGTGGATTGACTTTGATGGTCATGATTTTTTGAGAGAAAAAAAAAAAAAAAAGCGGCCATAAGGTGACATACCGGCGCCATCACGCCCCCACTCCCTTGTCAGAATAAGAGTTTTCCTCTGATCCATCTACCCCTCGCAATTGGTCTTCAC...

XM_057945349.1
ATCCAAGGGTGAAGTGGATTGACTTTGATGGTCATGATTTTTTGAGAGAAAAAAAAAAAAAAAAGCGGCCATAAGGTGACATACCGGCGCCATCACGCCCCCACTCCCTTGTCAGAATAAGAGTTTTCCTCTGATCCATCTACCCCTCGCAATTGGTCTTCACTTTAATTATAGAGAGTGAGTGATAACCCAGATCTCCATCATGGAAAACGCGGCTCAACTAAATAGCATTGCATCCTTGGAAAAGAAAAGAAAGCTGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131016652
ATGGAAAACGCGGCTCAACTAAATAGCATTGCATCCTTGGAAAAGAAAAGAAAGCTGCAAGATTCACAGCTAGAGATGCCTTCAGCAAAACAAGTTTGTCGAGAGAAGGTAGAAGGCGAAGAATTTGCTAAAGGTGCAGAATCAGAGCCCGAATCTACAAACAGCAACAGCTTCCACAGCAACTCTGCAGACTTGTTCATGTGCAGCGATGATGAAGATAAAACTGATGGCAAATTTCACGAATCAGGCGCATCTGATGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057801332.1
MENAAQLNSIASLEKKRKLQDSQLEMPSAKQVCREKVEGEEFAKGAESEPESTNSNSFHSNSADLFMCSDDEDKTDGKFHESGASDEPSTSSASWAGTSSGDSLYSSENRSSINSSTSEPESSSVSKHQDCPDDQCRQFAEFGCDGHAEIQLYTDKELEDLLYSNGASPGGSFILSSGRWSVGQGKLDCSMKLETFPFIQLKFWLVQELSRRVSRS

XP_057801333.1
MENAAQLNSIASLEKKRKLQDSQLEMPSAKQVCREKVEGEEFAKGAESEPESTNSNSFHSNSADLFMCSDDEDKTDGKFHESGASDEPSTSSASWAGTSSGDSLYSSENRSSINSSTSEPESSSVSKHQDCPDDQCRQFAEFGCDGHAEIQLYTDKELEDLLYSNGASPGGSFILSSGRWSVGQGAKQEGKQKLTIDKEFEQYFSMLML

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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