当前解析结果
SmilChr03G002486| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002486 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002486 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002486 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 39521694 - 39524580 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131016656 |
|---|---|
| GeneID | 131016656 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016656 |
| 原始查询 | SmilChr03G002486 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016656 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057801342.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057801340.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057801342.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057801340.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801340.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:39521874 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B50,C65,D3,D8 |
Chr3:39521982 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B32,B72,B77 |
Chr3:39522039 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B22,B42,C16 |
Chr3:39522178 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C49 |
Chr3:39522188 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 19 | A11,B104,B140,B15,B2,B24,B26,B4,B45,B76,B8,C1,C17,C70,C72,C76,C77,C79,D2 |
Chr3:39522189 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C26 |
Chr3:39522791 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | C10,C18,C3,C70 |
Chr3:39522791 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | C10,C18,C3,C70 |
Chr3:39523362 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr3:39523370 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B115 |
Chr3:39523477 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr3:39523621 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B112,B88,C22 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
6 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。