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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002489`

染色体: Chr03 坐标: 39571282-39573787 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002489`
名称	SmilChr03G002489
描述	expansin-A6-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39571282 - 39573787 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016658`
GeneID	`131016658`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016658`
原始查询	`SmilChr03G002489`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-A6-like
产物	expansin-A6-like
Arabidopsis	`AT2G37640` (EXP3) Barwin-like endoglucanases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818341] identity=78.4; qcov=1; evalue=9.45e-151; confidence=high
Rice	`Os03g0822000` (OsEXPA7) - identity=81.6; qcov=0.932; evalue=2.03e-151; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0009664 (plant-type cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1); PF22514 (EXPB1_D1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016658

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057801346.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057801346.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801346.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801346.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801346.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39571708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B5,B57
`Chr3:39571713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:39571823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:39571879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B67,C6
`Chr3:39571929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr3:39573152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:39573180`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A23,B103,B124,B136,B138,B14,B2,B26,B7,B72,B8,B87,B97,C18,C20,C53,C57,C66,C81
`Chr3:39573189`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A23,B103,B124,B136,B138,B14,B18,B2,B26,B7,B72,B8,B87,B97,C18,C20,C53,C57,C66,C81
`Chr3:39573197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B5,B57,C25,D11
`Chr3:39573206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C81
`Chr3:39573214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:39573302`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	89	A11,A14,A16,A4,A5,A8,A9,B107,B121,B125,B127,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B14,B140,B17,B18,B2,B22,B26,B3,B30,B31,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B47,B49,B51,B54,B55,B58,B59,B68,B69,B71,B72,B73,B78,B8,B82,B83,B85,B87,B88,B91,B94,B97,C14,C17,C18,C2,C20,C23,C25,C26,C27,C34,C46,C5,C53,C55,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C63,C68,C69,C7,C75,C81,C83,C86,D10,D11,D4,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801346.1

263 aa

132

263

EXPB1_D1

DPBB_1

Expansin_C

PF22514 EXPB1_D1 40-131 aa PF03330 DPBB_1 70-159 aa PF01357 Expansin_C 170-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801346.1`	Pfam	`PF22514`	EXPB1_D1	Domain	40	131	1.3e-07	32.7	EXPB1-like domain 1
`XP_057801346.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	70	159	3.8e-22	79.0	Lytic transglycolase
`XP_057801346.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	170	247	1.8e-29	102.4	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945363.1
AAAAAATTAGAGCCTACCCCTCGTCCTCAGTAGCCCTCCCTCCAACCATAAGTAGTCCCCTCTTCTTCCTCCCCCAAAACCCCCCAAACCCCTCTCTCTCTCTCTAGCCTGCATTTGAGAACTCAAAAATGGCAGCAACAACTGCGACTCTGCTCCTCTGCATTGCCACTGCCCTCTGTTTCATCACCTCCGCCCAAGCCAGGATCCCCGGCGTCTACGCCGGCAGCCCCTGGGAGTCCGCCCACGCTACCTTCTACGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016658
ATGGCAGCAACAACTGCGACTCTGCTCCTCTGCATTGCCACTGCCCTCTGTTTCATCACCTCCGCCCAAGCCAGGATCCCCGGCGTCTACGCCGGCAGCCCCTGGGAGTCCGCCCACGCTACCTTCTACGGCGGCAGCGACGCCTCCGGCACCATGGGTGGCGCGTGCGGGTACGGCAACCTTTACAGCCAGGGGTACGGTGTGAACACGGCGGCGCTGAGCACGGCGCTGTTCAACAACGGGCTGAGCTGCGGGGCGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801346.1
MAATTATLLLCIATALCFITSAQARIPGVYAGSPWESAHATFYGGSDASGTMGGACGYGNLYSQGYGVNTAALSTALFNNGLSCGACFEIKCDAAQDAKWCNPGSPSILITATNFCPPNFALPSDNGGWCNPPRPHFDLAMPMFLKIAEYRAGIVPVNFRRIPCRKEGGIRFTINGFRYFNLVLVTNVAGAGDIVRVSIKGKNTQWLPMSRNWGQNWQSNANLVGQPLSFRVFGSDRRASTSVNVAPANWQFGQTFSGKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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