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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002493`

染色体: Chr03 坐标: 39715203-39718804 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002493`
名称	SmilChr03G002493
描述	oxysterol-binding protein-related protein 3A-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39715203 - 39718804 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016661`
GeneID	`131016661`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016661`
原始查询	`SmilChr03G002493`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oxysterol-binding protein-related protein 3A-like
产物	oxysterol-binding protein-related protein 3A-like
Arabidopsis	`AT5G02100` (UNE18) Oxysterol-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831841] identity=74; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0274000` - identity=74.1; qcov=0.969; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0015248 (GO:0015248); GO:0016020 (membrane); GO:0032934 (sterol binding); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01237 (Oxysterol_BP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016661

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057801348.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057801348.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057801348.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057801348.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057801348.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39716380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B93
`Chr3:39716392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B125,B76,B93,B94
`Chr3:39716413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B76,B93,B94
`Chr3:39717133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:39717426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:39717796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr3:39717823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr3:39718094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:39718364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:39718388`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B32
`Chr3:39718388`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801348.1

454 aa

227

454

Oxysterol_BP

PF01237 Oxysterol_BP 69-427 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801348.1`	Pfam	`PF01237`	Oxysterol_BP	Family	69	427	9.1e-109	364.4	Oxysterol-binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945365.1
CAGCCGCCTTCACACAGTCTCTAGAGATCCAAGAAATTCAAAAAAATCGGAGACTACGAAGACTTATCTTCAACTTCACAAAGTTTTGACTGTTCTTCAACCGCGTAAAAACCCCATCAATTGAAGCCATTATCATCCCAATTCCTTCCCATTATCACATTATTTTTCCATTTTTAAACAATCCCACAAGCCGCCAACCCATCATCAATAAAGCTGCACGATTTCTGCAAGATTCCGATACAGACATACATAATAAAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016661
ATGGCTTCGAATAACGATCCGAAGCAGGGATCTGGTTTTTTTGCTTCCTTTGCTTCCACAATTTCCAGCCTTGGCACCGCCATGTCCAAATCTGTTAATGGTTTGATTGGTTATGAAGGATTGCAAGTTATAAATCCTGATGGAGGAACTGAGGATGCTGAGGATGAAGCTCGCAAAGGGAGATGGAAGCAAGAGGATCGGGATAGTTACTGGAGAATGATGCAAAACTACATCGGTTCTGATGTCACATCTATGGTTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801348.1
MASNNDPKQGSGFFASFASTISSLGTAMSKSVNGLIGYEGLQVINPDGGTEDAEDEARKGRWKQEDRDSYWRMMQNYIGSDVTSMVTLPVLIFEPMTMLQKMAELMEYTYLLELADECEDPHMRLVYAASWFISVYPAIQRTWKPFNPILGETYELVNHGGITFIAEQVSHHPPMSAAHAENEHFVYDITSKLKTKFLGNSVDIYPVGRTRLTLKKSGVVLDLVPPLSKANNIIFGRTWVDSPGDMILTNLTTGEKVVLY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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