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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002497`

染色体: Chr03 坐标: 39758229-39760292 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002497`
名称	SmilChr03G002497
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39758229 - 39760292 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018791`
GeneID	`131018791`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018791`
原始查询	`SmilChr03G002497`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=30.4; qcov=0.838; evalue=1.69e-64; confidence=low
Rice	`Os03g0733400` - identity=30.7; qcov=1.01; evalue=2.55e-80; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF14372 (hAT-like_RNase-H); PF27039 (ZBED1_RNase-like_helical); PF27041 (ZBED1_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018791

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803483.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803483.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803483.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803483.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803483.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39758299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B108,C23
`Chr3:39758308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C35,C71
`Chr3:39758314`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B117,C68
`Chr3:39758314`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B117,C68
`Chr3:39758359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr3:39758366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:39758376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr3:39758414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:39758454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C5
`Chr3:39758469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B47,C6,D11
`Chr3:39758484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B64,C24
`Chr3:39758577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B8,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803483.1

562 aa

281

562

ZBED1_RNase-like

ZBED1_RNase-like_helical

hAT-like_RNase-H

PF27041 ZBED1_RNase-like 192-289 aa PF27039 ZBED1_RNase-like_helical 292-399 aa PF14372 hAT-like_RNase-H 393-479 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803483.1`	Pfam	`PF27041`	ZBED1_RNase-like	Domain	192	289	1.5e-29	102.7	ZBED1 RNase-like domain
`XP_057803483.1`	Pfam	`PF27039`	ZBED1_RNase-like_helical	Domain	292	399	2.8e-30	105.3	ZBED1 RNase-like helical domain
`XP_057803483.1`	Pfam	`PF14372`	hAT-like_RNase-H	Domain	393	479	6.9e-24	84.6	hAT-like transposase, RNase-H fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947500.1
ATGGAGAACTCAAATTTAATAGAAAATACACCTCAAGAAGATGAGATTATGGTGGAAGAAAATGAGGTGGAGAAAGAAGTTGTGGATATAAATGATGATAAAGATGATAATACAATAGAAGGAGATGATGGAGAGGAAGATAAAGAAGAAGGAGATGATGGAACTACAAAGCTTCAATGCATACATTGCAAGACTTTTCTTGCTAAGACGCCTACTGGCACAACATCTCATCTTTGGAATCACTTGAAGAGGTGTTTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018791
ATGGAGAACTCAAATTTAATAGAAAATACACCTCAAGAAGATGAGATTATGGTGGAAGAAAATGAGGTGGAGAAAGAAGTTGTGGATATAAATGATGATAAAGATGATAATACAATAGAAGGAGATGATGGAGAGGAAGATAAAGAAGAAGGAGATGATGGAACTACAAAGCTTCAATGCATACATTGCAAGACTTTTCTTGCTAAGACGCCTACTGGCACAACATCTCATCTTTGGAATCACTTGAAGAGGTGTTTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803483.1
MENSNLIENTPQEDEIMVEENEVEKEVVDINDDKDDNTIEGDDGEEDKEEGDDGTTKLQCIHCKTFLAKTPTGTTSHLWNHLKRCLQKKLHLKKQKTLQFQPVKSKFEMNPLSDGRYDHMKQREAVAHWILMGEQPFNAVENDGYTFIMSMNQPQFEKISRATAKKDVINVYNIEKKKMQLTLKDINKISLTTDIWKSKVQKISYMCVTGHFVDSEWQLQKRLLSFIPLPPPHGGVDIYDGLIKCTKDWGIEHKVFTISV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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