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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002505`

染色体: Chr03 坐标: 39900186-39902660 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002505`
名称	SmilChr03G002505
描述	protein TRM32
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39900186 - 39902660 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016670`
GeneID	`131016670`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016670`
原始查询	`SmilChr03G002505`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TRM32
产物	protein TRM32
Arabidopsis	`AT5G02390` (DAU1) TRM32-like protein (DUF3741) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830266] identity=32.3; qcov=0.937; evalue=4.6e-62; confidence=low
Rice	`Os12g0570500` (OsSTA286) - identity=37.6; qcov=0.277; evalue=1.32e-23; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12552 (DUF3741); PF14309 (DUF4378)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016670

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057801362.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057801363.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057801362.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801362.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801363.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39900330`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C29
`Chr3:39900330`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C29
`Chr3:39900445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:39900490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr3:39900689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:39900709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr3:39900711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C25
`Chr3:39900737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:39900750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C25
`Chr3:39900753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:39900837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B101
`Chr3:39900917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801362.1

671 aa

336

671

DUF3741

DUF4378

PF12552 DUF3741 182-223 aa PF14309 DUF4378 515-667 aa

XP_057801363.1

585 aa

292

585

DUF3741

DUF4378

PF12552 DUF3741 95-137 aa PF14309 DUF4378 429-581 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801362.1`	Pfam	`PF12552`	DUF3741	Domain	182	223	6.1e-07	30.3	Protein of unknown function (DUF3741)
`XP_057801362.1`	Pfam	`PF14309`	DUF4378	Domain	515	667	2.7e-35	122.9	LONGIFOLIA 1/2-like C-terminal domain
`XP_057801363.1`	Pfam	`PF12552`	DUF3741	Domain	95	137	5e-07	30.6	Protein of unknown function (DUF3741)
`XP_057801363.1`	Pfam	`PF14309`	DUF4378	Domain	429	581	2.4e-35	123.1	LONGIFOLIA 1/2-like C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945379.1
ATGAATTTTTACATTTTCAAATCTGTCTATGCAATCAGGCATCAACATTCTTGGCGATTTATTGATTCCAAACGAGTATGGCTGGGAATCATAAGAATACTACATCTTAGAGAATGGGTCGGAGTTTGCAAAAACAAGAATCACATATTGCATTGAAGCATCATGGGCCAGGCTGCATGTGGGGAATTCTTCACAATTTGCAGCAGAATAGATGGCACAAAGTCGTGAAAAAGCTCCCTCGTGCACGCCTCGTTCATGGA...

XM_057945380.1
GTCGTGAAAAAGCTCCCTCGTGCACGCCTCGTTCATGGAAGGCATTCCAATGGTGCTAAACCAGATGCTGAACAACTAGAGCAAGACGCAGCTGGGCCTTCAACACTCGTAAAATCTAATCCCGTCCCACAAAAGCTCGATGAAGTCGAGAATTAAAGCCTTCACGGATGAGGTGTATAAGAGGAAGGGCCGCCACCGGAGGAGCACATCTTACCCTGTAAGAAAACCACCCGATGAAAACCTTCCCTCACATCAGAAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016670
ATGGGTCGGAGTTTGCAAAAACAAGAATCACATATTGCATTGAAGCATCATGGGCCAGGCTGCATGTGGGGAATTCTTCACAATTTGCAGCAGAATAGATGGCACAAAGTCGTGAAAAAGCTCCCTCGTGCACGCCTCGTTCATGGAAGGCATTCCAATGGTGCTAAACCAGATGCTGAACAACTAGAGCAAGACGCAGCTGGGCCTTCAACACTCGTAAAATCTAATGTTGATCCTAGCCCGTCCCACAAAAGCTCGAT...

LOC131016670
ATGAAGTCGAGAATTAAAGCCTTCACGGATGAGGTGTATAAGAGGAAGGGCCGCCACCGGAGGAGCACATCTTACCCTGTAAGAAAACCACCCGATGAAAACCTTCCCTCACATCAGAAAGGGAAGTCTCTGGATGGCGTGGTGCCTCAAAACGCCGTTGAGGGTTCACACCACTCATCTGACTCCTCCTCACATCATCATGTGAGGTTGAACTATTTGAAGCAGAATGAGATTGATCAGCTTGGGGATCAGCCAATTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801362.1
MGRSLQKQESHIALKHHGPGCMWGILHNLQQNRWHKVVKKLPRARLVHGRHSNGAKPDAEQLEQDAAGPSTLVKSNVDPSPSHKSSMKSRIKAFTDEVYKRKGRHRRSTSYPVRKPPDENLPSHQKGKSLDGVVPQNAVEGSHHSSDSSSHHHVRLNYLKQNEIDQLGDQPIRDHTLVHGNLIYAIEPSRGDALQESKLFMDALTLLNVREEMFLNILKDPSISLTNQLHCRRSPNLRYGLNKSMSFAASAPSIARDFDD...

XP_057801363.1
MKSRIKAFTDEVYKRKGRHRRSTSYPVRKPPDENLPSHQKGKSLDGVVPQNAVEGSHHSSDSSSHHHVRLNYLKQNEIDQLGDQPIRDHTLVHGNLIYAIEPSRGDALQESKLFMDALTLLNVREEMFLNILKDPSISLTNQLHCRRSPNLRYGLNKSMSFAASAPSIARDFDDLEASRRKHETRCEDDDTKESCEVLDNAASPAAAAANILRKKSDENRAGLIHFKNIRDKIKYVIRDRKKEKNRIMMDALHHKVPYGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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