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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002508`

染色体: Chr03 坐标: 39934786-39936151 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002508`
名称	SmilChr03G002508
描述	uncharacterized SmilChr03G002508
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39934786 - 39936151 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018794`
GeneID	`131018794`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018794`
原始查询	`SmilChr03G002508`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0379800; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0379800; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G43260` (AT1G43260) hAT transposon superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840927] identity=41.1; qcov=0.61; evalue=8.22e-64; confidence=medium
Rice	`Os01g0379800` - identity=39.4; qcov=0.832; evalue=2.23e-75; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018794

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803486.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803486.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803486.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803486.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803486.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39934793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:39934798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:39934803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:39934840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B78
`Chr3:39934860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B55,C2
`Chr3:39934868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B32,C17,C87
`Chr3:39934912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C18,C54
`Chr3:39934917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B102,B118,C2
`Chr3:39934920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B139,B32
`Chr3:39934927`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A24,B20,B54,B59,B71,C50,D8
`Chr3:39934930`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A24,B20,B54,B59,B71,C50,D8
`Chr3:39934963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803486.1

387 aa

194

387

DUF659

PF04937 DUF659 124-274 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803486.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	124	274	7.3e-56	188.7	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947503.1
ATGGATTCGATTCCTCACTTTGATGAGGTAGACAACATGGTGAAAGTAGTAGATGATGAAGTAGACGTTTCACAGGCAAAACCTCATGGAAAACGGCCATCAGTTGAGGCATCTACAAATTCTATAGCATTGAAGAAACCACGGAATATTGGTCATTTGGATTTGATCTACCAGAAGCTACCGAATGCGAAGAGTTCCAAAACTTCACAATCACAATTTGAAGAAGCTCAAAAGAAGTTAAGGGAGGCTGCCGTTGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018794
ATGGATTCGATTCCTCACTTTGATGAGGTAGACAACATGGTGAAAGTAGTAGATGATGAAGTAGACGTTTCACAGGCAAAACCTCATGGAAAACGGCCATCAGTTGAGGCATCTACAAATTCTATAGCATTGAAGAAACCACGGAATATTGGTCATTTGGATTTGATCTACCAGAAGCTACCGAATGCGAAGAGTTCCAAAACTTCACAATCACAATTTGAAGAAGCTCAAAAGAAGTTAAGGGAGGCTGCCGTTGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803486.1
MDSIPHFDEVDNMVKVVDDEVDVSQAKPHGKRPSVEASTNSIALKKPRNIGHLDLIYQKLPNAKSSKTSQSQFEEAQKKLREAAVEKFARWMYDAGISFNAVQYDSFKPMIEAIGQYGPGMKPPSFHEVRVPYLKKEIEHTKLIMKEHEEQNVKYGCTLMSDGWRDKKGRSLINFLVNTPKGSMFVKSVDVSEYSHTGMKMLELLDKFVQEVGENHVVQVVTDSASNNVYAGKLLEEKYKHIFWSPCAAHCLDLMFEDIF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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