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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002509`

染色体: Chr03 坐标: 39954592-39957361 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002509`
名称	SmilChr03G002509
描述	probable protein phosphatase 2C 4
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39954592 - 39957361 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016673`
GeneID	`131016673`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016673`
原始查询	`SmilChr03G002509`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 4
产物	probable protein phosphatase 2C 4
Arabidopsis	`AT1G07630` (PLL5) pol-like 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837276] identity=53.7; qcov=1.14; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0821300` (XB15) - identity=49.1; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0006470 (protein dephosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016673

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057801364.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057801364.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801364.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801364.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801364.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39954817`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B6
`Chr3:39954817`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B6
`Chr3:39954854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B23,C27
`Chr3:39954860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:39954914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C55,D8
`Chr3:39954992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C18,C54
`Chr3:39955064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:39955097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr3:39955640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr3:39955712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B101,B78,B8
`Chr3:39955844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:39956061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801364.1

617 aa

308

617

PP2C

PF00481 PP2C 364-557 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801364.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	364	557	1.1e-29	104.6	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945381.1
AGAAAAGCATTCAATTTAAAAACAAAATCGAAATTTTTATTCTCAACTCCCGTCACCCTTCCCAAAGTCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTACACATTTATCTTCGTCCCATCTCTCTCTCTCTTCTTCAACTCCAACACCAAACCGTGAATTCTCTCTCTCCCCCCTTCCTCTACTAGAGAAAGAGAAACAAGAATTGAACATTTCCATCATCGCATAAACAGAAATGGGAAATGGAATCGGAAAGCTGAGTCTGTGCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016673
ATGGGAAATGGAATCGGAAAGCTGAGTCTGTGCTTCGCCGGAGACGCCGGCGAGATTTCCCGGCGGCGCAACGACGTGGCAGTGTGCCTATCGGAGCCGCTGGACGAGGGGTTGGGGCACTCGTTCTGCTACATCCCGCCCGACCCTCTTCACAAAATCCAATCTTTGGACGACCCGTCAACCTCACAAACGACGGCGTACCGCACCATCTCCGGCGCCTCCATCTCCGCCAACACCTACACCCCTCTCTCCACCGCTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801364.1
MGNGIGKLSLCFAGDAGEISRRRNDVAVCLSEPLDEGLGHSFCYIPPDPLHKIQSLDDPSTSQTTAYRTISGASISANTYTPLSTAYTASDSIDKASAFESSNFFSSIPLQPIPRNSISTVKSGPILRNSGPISGQIERGFLSGPIERSFISGPLENQYDQQLQRYKPKSKKWGLLKKIASKSFWGFSKELGKNHHHQNIEHHNHIPSSSSNSGNSSTITSHNLSTDMSLIDENDDVGDESFGSQNVQWAQGKAGEDRVH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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