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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002514`

染色体: Chr03 坐标: 40011501-40012238 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002514`
名称	SmilChr03G002514
描述	uncharacterized SmilChr03G002514
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	40011501 - 40012238 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018796`
GeneID	`131018796`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018796`
原始查询	`SmilChr03G002514`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=36.2; qcov=0.563; evalue=4.29e-14; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=38; qcov=1.15; evalue=8.94e-47; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018796

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803489.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803489.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803489.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803489.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803489.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:40011531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B118,C2
`Chr3:40011545`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A18,A19,A5,A7,B126,B132,B33,B67,B97,C32,C46,C50,C51,C53,C68
`Chr3:40011573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,C28,C83,C85
`Chr3:40011617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr3:40011633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,C33,C4
`Chr3:40011640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B117,B94,D1
`Chr3:40011648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C82
`Chr3:40011650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:40011677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B80
`Chr3:40011684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	B107,B127,B20,B23,B4,B40,B5,B56,B57,B62,B78,B88,B9,B96,C27,C3,C62,C64,C66,C8,C80,C81,C86
`Chr3:40011693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B117,D1
`Chr3:40011699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,C16,C34,C63,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803489.1

206 aa

103

206

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 69-96 aa PF04827 Plant_tran 136-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803489.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	69	96	2.8e-10	40.5	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057803489.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	136	206	1.7e-22	80.8	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947506.1
ATGTTTTCATCTTCTTTTGAGCATGATGCTGAAGACACAGCTGCAGCTGCAGCTAAAGTTGTAGCTGAAGCTGATGCCTTTATAGAAGAGTACATGCATAAGTACATGGAGGATGACAGTATCCATGAACGTGTTCTTCGAGTAATAGCGTCAAACACACGTCACACCAGAAGATACGCGCAACGAGATTGGGAAAGAGCATACGAGCGACTCATGAGGGATTATTTTGATGATAATCCAACATGGGGTCTCAATGTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018796
ATGTTTTCATCTTCTTTTGAGCATGATGCTGAAGACACAGCTGCAGCTGCAGCTAAAGTTGTAGCTGAAGCTGATGCCTTTATAGAAGAGTACATGCATAAGTACATGGAGGATGACAGTATCCATGAACGTGTTCTTCGAGTAATAGCGTCAAACACACGTCACACCAGAAGATACGCGCAACGAGATTGGGAAAGAGCATACGAGCGACTCATGAGGGATTATTTTGATGATAATCCAACATGGGGTCTCAATGTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803489.1
MFSSSFEHDAEDTAAAAAKVVAEADAFIEEYMHKYMEDDSIHERVLRVIASNTRHTRRYAQRDWERAYERLMRDYFDDNPTWGLNVFRRHFRMRKEQLAYGGPADHYDEYLQVYETTGYECLRHFCRGVIEIFGAHYLRRPTVYDYQQLMEMHEQMHGFPGMIGNLDSMHWTCKNCLVAWKGQFTRSDHGVPTIMLEVVASQDFWI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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