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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002517`

染色体: Chr03 坐标: 40097042-40098714 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002517`
名称	SmilChr03G002517
描述	dof zinc finger protein DOF2.4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	40097042 - 40098714 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016681`
GeneID	`131016681`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016681`
原始查询	`SmilChr03G002517`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dof zinc finger protein DOF2.4-like
产物	dof zinc finger protein DOF2.4-like
Arabidopsis	`AT3G55370` (OBP3) OBF-binding protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824703] identity=40; qcov=1.14; evalue=1.8e-60; confidence=medium
Rice	`Os03g0821200` (OsDof16) - identity=38.2; qcov=1.29; evalue=8.32e-47; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02701 (Zn_ribbon_Dof)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016681

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801371.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801371.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801371.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801371.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057801371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:40097487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:40097591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:40097654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B118,B22,C50
`Chr3:40097711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:40097713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:40097759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:40097804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:40097849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:40097864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B26,B51,B59,C15
`Chr3:40097987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B129,B132,B2,B44
`Chr3:40098047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:40098076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801371.1

318 aa

159

318

Zn_ribbon_Dof

PF02701 Zn_ribbon_Dof 75-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801371.1`	Pfam	`PF02701`	Zn_ribbon_Dof	Family	75	131	3.4e-33	114.3	Dof domain, zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945388.1
AAAGCAACGAACAAACAAAACTAGACAGAGTGAAAACAAATTAGTACGTGCTTTGTTTCTATGAAATCACTGTATCTATACTATATCTATCTCTCTCTCTATCTATATATATACAAGCATAAAGCTCCCTGCTTTATTTTAGCTCCTATATTCCCATTCTTCCTTTATCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGCTTCCAGTTGATGTGATTCTCCACTAGAGCTCCAAAAACCCCATACCCTTTACAAAAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016681
ATGGTTTTTTCTTCAGTTCCAGCTTATCTTGATCCATCCAATTGGCATCAGCCACAAAATCATCATATAATTGGCAGCAGCGGCACAAACCACCATCTACTCCCACCACAGCAGCCGGCGGCGACGCCCCCGCCTCCTCCGCAGCCCCATGGCGGCGGATCATCGATCCGGCCGGGCACGATGTCGGAGCGGGCCCGCATGGCGAACGTGCCGATGCCGGATTCATCCCTAAAATGCCCTCGCTGCGAATCCACCAACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801371.1
MVFSSVPAYLDPSNWHQPQNHHIIGSSGTNHHLLPPQQPAATPPPPPQPHGGGSSIRPGTMSERARMANVPMPDSSLKCPRCESTNTKFCYFNNYSLSQPRHFCKTCRRYWTRGGALRNVPVGGGCRRNKRSKSTSSKSSPASGDRQTTSTSTSTISTSAGMLGQFPPLRFMSPLSQLTDNFAGDMGLNYSAPPVGTSEMGFHGAGGMASLLSSVGGIEPWRLQQVQQFPFFGGLEASAPGNYQFHGGESGFLNHEASRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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