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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002523`

染色体: Chr03 坐标: 40216268-40219071 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002523`
名称	SmilChr03G002523
描述	uncharacterized SmilChr03G002523
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	40216268 - 40219071 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016688`
GeneID	`131016688`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016688`
原始查询	`SmilChr03G002523`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818333]; symbol=SLT1; hit=AT2G37570; species=arabidopsis; confidence=high
产物	HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818333]; symbol=SLT1; hit=AT2G37570; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G37570` (SLT1) HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818333] identity=79.1; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0151100` (SLT2) - identity=61.6; qcov=1.1; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26144 (ACL_Hsps-like); PF26145 (DUF8041)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016688

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057801375.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801375.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801375.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801375.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801375.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:40217470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:40218043`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	39	A19,A21,A3,A5,B110,B117,B118,B123,B137,B14,B16,B17,B19,B33,B42,B54,B55,B60,B67,B7,B77,B93,B94,B96,C19,C23,C3,C36,C39,C40,C41,C51,C7,C82,C83,D2,D5,D7,D8
`Chr3:40218049`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	A19,A21,A3,A5,B101,B110,B117,B118,B123,B130,B137,B14,B16,B17,B19,B33,B42,B54,B55,B60,B67,B77,B93,B94,B96,C19,C23,C3,C36,C39,C40,C41,C51,C7,C82,C83,D2,D5,D7,D8
`Chr3:40218052`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	40	A19,A21,A3,A5,B101,B110,B117,B118,B123,B130,B137,B14,B16,B17,B19,B33,B42,B54,B55,B60,B67,B77,B93,B94,B96,C19,C23,C3,C36,C39,C40,C41,C51,C7,C82,C83,D2,D5,D7,D8
`Chr3:40218065`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A19,A21,A3,A5,B110,B117,B118,B123,B137,B14,B16,B17,B19,B33,B42,B54,B55,B60,B67,B75,B77,B93,B96,C19,C23,C3,C36,C39,C40,C41,C51,C7,C82,C83,D2,D5,D7
`Chr3:40218098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:40218193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C6
`Chr3:40218320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C27
`Chr3:40218391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:40218509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B81,C14,C20,C42
`Chr3:40218608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:40218788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801375.1

501 aa

250

501

DUF8041

ACL_Hsps-like

PF26145 DUF8041 95-261 aa PF26144 ACL_Hsps-like 367-475 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801375.1`	Pfam	`PF26145`	DUF8041	Domain	95	261	4.1e-103	343.1	Domain of unknown function (DUF8041)
`XP_057801375.1`	Pfam	`PF26144`	ACL_Hsps-like	Domain	367	475	1.2e-56	190.3	Hsps-like alpha-crystallin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945392.1
AAGAAGGTCCAAACGGCGCCGTCGGGCTTTAGCCCGGCGATATTCGGTGCCGGCTTTTACCTCTCCACTTCCTTCTATAAATATCACTCTCATTTCAACATTTACATTTTCTCCTTCTCCAATATAACCTCTTTTTACGCCTTCTTTTTTCCCCCTTTTTTCCATGTTAAATACTTTCTGTTTGACTGCGTCTGCACAAAACTTGTTCAAGATAAAGCAGTAATTCTCGTCAAAATTGGTAGTTACGAGGAGAAATTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016688
ATGGGAGATACACTTCTGACTGGTTTGTCAATGGAGAATCATCACCCTTCAACCATCTTGTCCATGGATTCAAGTGCCTCATCCTCCCATGAAGAACTAGACCTTGAGATGAATCGCCAAGTTATTTTGACCCGCCCACCTGATATCAATTTGCCCCTTTCAGCTGAGCGAAGCCCCCCTCCACAGCCTTGGAATCCTGAACCGTGTGATATTCTTGATGTTGGGCTAGGTACTCAAATATACGAGACCGAGAGTTTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801375.1
MGDTLLTGLSMENHHPSTILSMDSSASSSHEELDLEMNRQVILTRPPDINLPLSAERSPPPQPWNPEPCDILDVGLGTQIYETESFLVAPKVGRKCAKRVDSIWGAWFFFSFYFKPVLNEKSKAKIIRDSNGVSGFDKSDLQLDTFMVQHDMENMYMWVFKERPENALGKMQLRSYMNGHSRQGERPFPFSVDKGFVRSHRMQRKHYRGLSNPQCVHGIEVVPSPNLMALDEDDRKRWTELTGRDASLTIPPEASDYGSW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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