当前解析结果
SmilChr03G002530| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002530 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002530 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002530 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 40367090 - 40367539 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018799 |
|---|---|
| GeneID | 131018799 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018799 |
| 原始查询 | SmilChr03G002530 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018799 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803491.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057803491.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057803491.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057803491.1 |
| 5 | Nucleolar fibrillar center | Nucleolar fibrillar center | 0.20000 | XP_057803491.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:40367093 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 14 | A22,B11,B129,B131,B2,B57,C35,C37,C41,C48,C64,C66,C83,D8 |
Chr3:40367121 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 157 | A1,A10,A11,A13,A15,A18,A19,A2,A23,A3,A4,A7,A8,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B104,B107,B108,B111,B113,B115,B117,B118,B121,B123,B124,B125,B127,B128,B130,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B140,B16,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B29,B3,B30,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B46,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B59,B61,B62,B64,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B75,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B84,B85,B86,B88,B9,B93,B95,B96,B98,C1,C12,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C23,C27,C28,C3,C30,C31,C35,C36,C37,C38,C39,C42,C43,C44,C45,C49,C5,C50,C51,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C65,C66,C7,C71,C74,C75,C77,C79,C80,C81,C82,C84,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D5,D6 |
Chr3:40367122 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D9 |
Chr3:40367122 |
C |
CT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | D9 |
Chr3:40367144 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,B2,B60 |
Chr3:40367167 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B135,B98,C14 |
Chr3:40367180 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C4 |
Chr3:40367188 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B95,B98 |
Chr3:40367190 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C4 |
Chr3:40367195 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B125,B48,C60,C73 |
Chr3:40367199 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B135,B18,B2,B42,C14 |
Chr3:40367201 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B94,B95,B98 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。