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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002532`

染色体: Chr03 坐标: 40379820-40380477 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002532`
名称	SmilChr03G002532
描述	B3 domain-containing protein Os03g0120900-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	40379820 - 40380477 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016693`
GeneID	`131016693`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016693`
原始查询	`SmilChr03G002532`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein Os03g0120900-like
产物	B3 domain-containing protein Os03g0120900-like
Arabidopsis	`AT2G46870` (NGA1) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819300] identity=80.2; qcov=0.5; evalue=2.42e-40; confidence=medium
Rice	`Os03g0120900` - identity=52; qcov=1.01; evalue=7.06e-43; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016693

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801380.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801380.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801380.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801380.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057801380.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:40379834`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B119
`Chr3:40379834`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B119
`Chr3:40379884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B78,C49,C64,C66
`Chr3:40379915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B131,B53,C36
`Chr3:40379942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B69,C15,C6
`Chr3:40379961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C21
`Chr3:40379979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B82
`Chr3:40379994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C58,C87
`Chr3:40379998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B100,B21,B43,C14,D1
`Chr3:40379998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B21,B43,C14,D1
`Chr3:40380000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B119,C14,D1
`Chr3:40380030`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A9,B124,B55,B79,D4,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801380.1

172 aa

172

PF02362 B3 8-78 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801380.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	8	78	1.6e-17	63.9	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945397.1
CTGGACTCGACGTCCACAAACGAGAAGGGTTTGCTGCTGAATTTCAAGGACCGGAATGGGAAGCCATGGCGGTTTCGCTACTCCTACTGGAACAGCAGCCAGAGCTACGTGATGACCAAGGGCTGGTCCCACTTCGTCAAGGAGAAGAAGCTCGACGCCGGCGACATCGTCTCCTTCCAGCGCGGCGTCGGCGAGCTCGCCAAGGACCGCCTCTTCATCGACTGGCGCCGCCGCCCCGACGCCCCCGACCTGCCCCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016693
CTGGACTCGACGTCCACAAACGAGAAGGGTTTGCTGCTGAATTTCAAGGACCGGAATGGGAAGCCATGGCGGTTTCGCTACTCCTACTGGAACAGCAGCCAGAGCTACGTGATGACCAAGGGCTGGTCCCACTTCGTCAAGGAGAAGAAGCTCGACGCCGGCGACATCGTCTCCTTCCAGCGCGGCGTCGGCGAGCTCGCCAAGGACCGCCTCTTCATCGACTGGCGCCGCCGCCCCGACGCCCCCGACCTGCCCCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801380.1
LDSTSTNEKGLLLNFKDRNGKPWRFRYSYWNSSQSYVMTKGWSHFVKEKKLDAGDIVSFQRGVGELAKDRLFIDWRRRPDAPDLPLSHHFSFHQRNSSLHHSWSPLLIPPPPPPRDYSHLLHHHYHPNHHPPTGYGPYAYGSVVNGNPCPPGSIVYLRGGGGGAGAKRADGF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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