当前解析结果
SmilChr03G002536| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002536 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002536 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002536 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 40427741 - 40428405 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016697 |
|---|---|
| GeneID | 131016697 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016697 |
| 原始查询 | SmilChr03G002536 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | forkhead box protein G1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818329]; symbol=AT2G37530; hit=AT2G37530; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | forkhead box protein G1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818329]; symbol=AT2G37530; hit=AT2G37530; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT2G37530 (AT2G37530)forkhead box protein G1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818329] identity=52.4; qcov=0.84; evalue=3.86e-32; confidence=medium |
| Rice | Os12g0566600- identity=43; qcov=0.8; evalue=2e-15; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016697 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057801382.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057801382.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.80000 | XP_057801382.1 |
| 4 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.20000 | XP_057801382.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057801382.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:40427868 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B48,C73 |
Chr3:40428003 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,A3,B124,B49,B79 |
Chr3:40428056 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C56 |
Chr3:40428187 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B67,B97,C46 |
Chr3:40428206 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B123 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。