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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002555`

染色体: Chr03 坐标: 40726851-40729666 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002555`
名称	SmilChr03G002555
描述	protein ALUMINUM SENSITIVE 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	40726851 - 40729666 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016714`
GeneID	`131016714`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016714`
原始查询	`SmilChr03G002555`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALUMINUM SENSITIVE 3
产物	protein ALUMINUM SENSITIVE 3
Arabidopsis	`AT2G37330` (ALS3) aluminum sensitive 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818310] identity=77.6; qcov=0.996; evalue=3.7e-144; confidence=high
Rice	`Os05g0119000` (STAR2) - identity=77; qcov=0.973; evalue=2.01e-135; confidence=high
GO	GO:0010044 (response to aluminum ion)
KEGG	-
Pfam	PF03649 (UPF0014)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016714

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057801398.1`
2	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.40000	`XP_057801398.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057801398.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057801398.1`
5	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057801398.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:40727185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,C20,C27
`Chr3:40729380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801398.1

264 aa

132

264

UPF0014

PF03649 UPF0014 15-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801398.1`	Pfam	`PF03649`	UPF0014	Family	15	250	3.6e-67	227.0	Uncharacterised protein family (UPF0014)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945415.1
AGCTATTTCGTATGGGGCCGTACGTACCTTTTTTCCTACACAAATGCAAGATACCAACTCCACCATAAAAACCAATATTATTTCCATTCCCATCAGGGGAAGGTTTCTTCACCACAACCACTCACACATTTACACGAAAATGTCCACTACTAATTAATTAATTATATATTCCCCCTTCATTTATAGATAAGATATAGTACCTATATGATGAATTAGTTGTAGGAATTAATGGAGTGGGAATGGGCGTTAGAGTTCTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016714
ATGGAGTGGGAATGGGCGTTAGAGTTCTTGAAGGGCATGATCCAGCCGGTGGCGGCGCTGTCTGTGGTGGCGATGGCGGTGGCGCTCTCGTATTTTCAGAAGCTGGGGCTGGAGTGGGAGATGGCCTACTCCATCTTCAGAGCTTTTCTTCAGCTCTCCATCATTGGATTTGTTTTGGAGTTCATTTTCAAACAGGACAATGCTATATGGATCCTCATGGCTTATCTTTTCATGGTGTCGGTTGGCGGTTACACGGCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801398.1
MEWEWALEFLKGMIQPVAALSVVAMAVALSYFQKLGLEWEMAYSIFRAFLQLSIIGFVLEFIFKQDNAIWILMAYLFMVSVGGYTAGQRAKQVPGGTYVAGASILVGTGITMFLLVTLRVFPFTPRYIIPVAGMMVGNAMTVTGVTIKKLRDDIKIQMSLVETALALGATPRQATLQQVKRSLVIALSPVLDNAKTVGLISLPGAMTGLIMGGASPLQAIQLQIVVMNMLVGASTVSSIMSTYLSWPSFFTKAYQLETNV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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