当前解析结果
SmilChr03G002559| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002559 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002559 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002559 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 40747140 - 40750800 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018807 |
|---|---|
| GeneID | 131018807 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018807 |
| 原始查询 | SmilChr03G002559 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018807 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803498.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057803498.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803498.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803498.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803498.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:40747140 |
A |
ATT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 18 | A5,B113,B136,B16,B19,B45,B59,B6,B8,C38,C44,C50,C65,C69,C7,C78,C82,D2 |
Chr3:40747144 |
T |
TTG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C9 |
Chr3:40747144 |
T |
TTG |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr3:40747753 |
GCA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B94 |
Chr3:40747753 |
GCA |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr3:40747773 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B74 |
Chr3:40747834 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A14,B5,B50,B6,B77,B94 |
Chr3:40747842 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 37 | A22,A6,A8,B102,B108,B111,B125,B127,B134,B137,B16,B24,B29,B35,B44,B63,B64,B66,B71,B75,B81,B98,C15,C16,C23,C33,C37,C39,C4,C44,C54,C60,C64,C80,C84,D2,D9 |
Chr3:40747847 |
GTC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 34 | A22,A6,A8,B102,B108,B111,B127,B134,B137,B16,B24,B29,B35,B44,B63,B64,B66,B71,B75,B81,C15,C16,C23,C33,C37,C39,C4,C44,C54,C64,C80,C84,D2,D9 |
Chr3:40747856 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 34 | A22,A6,A8,B102,B108,B111,B127,B134,B137,B16,B24,B29,B35,B44,B63,B64,B66,B71,B75,B81,C15,C16,C23,C33,C37,C39,C4,C44,C54,C64,C80,C84,D2,D9 |
Chr3:40747894 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C72 |
Chr3:40747910 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A19,B126,B131,B67,C46 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。